原创 cBioPortal學習筆記（2）
這是cbioPortal官網視頻的第二個教程。這個教程裏有部分內容是和第一講重複的。我並沒有把視頻裏所有的例子都截圖記錄，只記錄了我認爲重點的地方。如果有同學想看全部視頻內容，請前往這裏觀看。 首先在cBioPortal首頁，選擇MSK
2021-03-30 12:19:48
原创 CUT&RUN實驗原理和步驟
這篇筆記是記錄CUT&RUN實驗的具體步驟。因爲下週就要做CUT&RUN了，首先就要先熟悉一下實驗步驟。雖然有紙質版的protocol，但是老闆推薦我去試劑盒官網看一下視頻，可以更清晰的瞭解一下原理和步驟，以及注意事項。官網視頻：http
2021-03-30 12:19:48
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原创 cBioPortal學習筆記（1）
進入新實驗室一週多了，一直忙着各種的training，空閒時間都在讀文獻，老闆一直強調“磨刀不誤砍柴功”，所以一直也不讓我着急上手做課題。但是並不影響老闆給我佈置任務，首先要熟悉的就是cBioPortal數據庫，這個數據庫之前我只看過幾次
2021-03-30 12:19:48
原创 NATURE:組蛋白變體在調節染色質組織和功能中的作用
牛年第一篇文獻閱讀筆記~這是一篇發表在2020年9月份Nature上的綜述。文獻的題目是：The roles of histone variants in fine- tuning chromatin organization and f
2021-03-22 19:05:41
原创 NATURE:組蛋白甲基轉移酶NSD3異常活化可誘導肺鱗狀細胞癌的發生
大年三十前的最後一篇筆記~ 這篇Nature文章同樣是在今年2月3號這天online的。文章題目是： Elevated NSD3 histone methylation activity drives squamous cell lung
2021-03-22 18:58:36
原创 NATURE:組蛋白標記H3K36me2招募DNMT3A並調節基因間DNA甲基化分佈
這篇文獻是於2019年9月發表在Nature上的一篇研究型文章。題目是：The histone mark H3K36me2 recruits DNMT3A and shapes the intergenic DNA methylation
2021-03-22 18:58:36
原创 NATURE:基因-環境協同誘導的表觀遺傳程序起始腫瘤發生
這是一篇非常新的文獻。發表於今年的2月3號（online），也就是一週前。 文章的題目是： A gene–environment-induced epigenetic program initiates tumorigenesis 雜誌：
2021-03-22 18:58:36
原创 新英格蘭醫學：癌症的表觀遺傳治療
這篇筆記記錄的是2020年8月發表在新英格蘭醫學雜誌上（影響因子74）的一篇綜述。題目是：Epigenetic Therapies for cancer。文章主要介紹了目前的表觀遺傳治療方法（主要介紹在cancer方面的），和一些已經被F
2021-03-22 18:55:24
原创 Epigenetics文獻學習：組蛋白標記在控制轉錄週期中的功能作用
這一篇文章是於2017年發表在Trends in Biochemical Sciences雜誌上的綜述，這個雜誌是一個10多分的雜誌。更重要的是，這篇文章的第一作者目前在C.David Allis實驗室做博後，這篇綜述應該是她在進入C.
2021-02-02 09:13:08
原创 Epigenetics文獻學習：Histone H3突變的致癌機制
這篇文獻的通訊作者是C.David Allis和他的一個學生，於2017年發表在Cold Spring Harb Perspect Med雜誌上，也不是一篇影響因子非常高的文章，但是因爲通訊作者有“表觀遺傳大佬”，所以就拿來學習。這篇文章
2021-01-31 06:04:36
原创 Epigenetics文獻學習：Writing, erasing and reading histone lysine methylation
這篇文獻是2017年發表在Experimental & Molecular Medicine上的，雜誌的影響因子雖然不高，但是內容相對比較全面。介紹了組蛋白賴氨酸上主要的甲基化位點相關酶，以及不同位點甲基化的功能和作用。筆記內容較長，但不
2021-01-30 05:13:46
原创 簡書筆記彙總，持續更新中...
以下是我簡書裏所有的文章鏈接，按不同的專題分類，方便大家根據不同專題以及文章題目快速的查看所需內容。 持續更新中~ Linux學習筆記 《Linux命令行與shell腳本編程大全》第11章筆記（上） 《Linux命令行與shell腳本編程大
2021-01-28 23:11:19
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原创 Epigenetics文獻學習：染色質結構域
這一篇文獻閱讀的筆記比較詳細，文獻題目是Chromatin Domains: The unit of chromosome organization。是2016年發表在Molecular Cell上的一篇綜述。內容主要集中在染色質組織結構
2021-01-28 23:11:19
原创 Epigenetics文獻學習：Regulation of chromatin by histone modifications
由於是剛開始深入學習histone modification相關知識，所以閱讀的文獻也會相對“古老”一些，但是學習基礎知識的一個比較好的開始。這篇筆記記錄的是一篇綜述，題目是Regulation of chromatin by histo
2021-01-28 23:11:19
原创 Epigenetics文獻閱讀：The molecular hallmarks of epigenetic control
這篇文獻是表觀領域“大牛”C.David Allis和Thomas在2016年發表的一篇綜述。文章裏講述了表觀遺傳學的發展歷程，以及一些研究進展。這篇文獻我沒有自己翻譯，因爲找到了一篇翻譯的很好的文章了： Nat Rev Genet |
2021-01-28 23:11:19