組合多個GSE數據集進行meta分析不妨先去冗餘

發現一個工具,發表在 BMC Bioinformatics201415:323 https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-323,很簡單的設計,就是考慮到做多個GSE數據集的meta分析的人越來越多了,但是很多人都瞎搞,整合數據集的時候沒有去冗餘。

所以作者開發這個R包: DupChecker: a bioconductor package for checking high-throughput genomic data redundancy in meta-analysis

既然是R包,那麼學習起來就很容易了。

meta分析都想做,結果第一步就失策,哈哈,反思一下!

我的領域最出名的GSE數據集的meta分析應該就是2011年的TNBC了,如下:

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