通常自己的目標基因要在公共數據庫看是否影響生存

看到一篇文章提到了這個分析,其實這樣的分析已經常規化了。 文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-018-04987-y

重點是作者對自己的生物學領域背景知識的把控能力,比如首先應該是知道哪些數據集是可以拿來使用的。

作者使用的是Tothill的2008文章的數據集,發現自己感興趣的基因的兩個探針都顯著性的影響生存,文章是:Tothill, R. W. et al. Novel molecular subtypes of serous and endometrioid ovarian cancer linked to clinical outcome. Clin. Cancer Res. 14, 5198–5208 (2008).

常規化流程,不會代碼的可以利用網頁工具,會代碼的當然是在R裏面探索各式各樣的數據集咯 。

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