計算MiRNA–mRNA表達相關性

看到一篇文章提到了這個分析,作者下載了TCGA數據庫的OV的Affymetrix HT HG-U133A arrays, n = 598表達矩陣和Agilent 8 × 15 K Human miRNA-specific microarray的表達矩陣。

使用 Maximal Information Coefficient (MIC) 這個算法來計算計算MiRNA–mRNA表達相關性,這個算法來自於文獻:D. N. et al. Detecting novel associations in large data sets. Science 334, 1518–1524 (2011).

感興趣的朋友可以看看這個算法的實現,肯定不是普通的皮爾森相關係數啦。

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