TCGA數據庫的腫瘤病人也是有藥物反應信息的

在August 2018文章看到,作者使用了 49 FDA approved drugs to the 5605 tumor samples from 21 cancer types 這樣的信息。

To determine whether cancer cell line based LENP model could predict patient drug response, we applied the LENP models to TCGA tumor lncRNA expression profile and predicted patient drug response across 21 cancer types

作者使用生存曲線來作爲藥物治療的指標,而一個病人通常會受到多個藥物治療,所以需要根據NCCN治療指南來矯正不同藥物作用。

作者還找TCGA團隊申請了 病人的原始治療記錄。

也就是說其實TCGA數據庫的腫瘤病人也是有藥物反應信息的,如果拿的,那數據挖掘的方法就更加豐富了。

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