在作圖的時候想拼接不同的圖形對象,如pheatmap
包的熱圖、ggplot2
對象以及 base 圖形等。 這裏找到了Y叔的ggplotify
包,以下是對 Vignette 的翻譯,以幫助自己理解用法,也希望讀者受益。
查看源代碼發現僅僅 4 個文件,加起來 100 多行代碼的樣子居然能有如此神效,有空一定要讀源碼學習下~
grid
library("grid")
library("ggplotify")
p1 <- as.grob(~barplot(1:10))
p2 <- as.grob(expression(plot(rnorm(10))))
p3 <- as.grob(function() plot(sin))
library("vcd")
data(Titanic)
p4 <- as.grob(~mosaic(Titanic))
library("lattice")
data(mtcars)
p5 <- as.grob(densityplot(~mpg|cyl, data=mtcars))
as.grob
函數接收繪製圖形的 expression
、公式或者函數等。圖形可以由基礎圖形生成 (p1
, p2
, p3
) 或者 grid
(p4
)。如果圖形產生了圖形對象,它可以直接用於其他 工具包lattice
、meme
和UpSetR
等的輸入。
因爲這裏將圖形轉換爲了grob
對象,所以它兼容grid
圖形系統與相關工具包。
我們現在可以使用grid.draw
繪製p1
和p2
,以及使用pushViewport
進行圖形嵌入。
grid.newpage()
grid.draw(p1)
vp = viewport(x=.35, y=.75, width=.35, height=.3)
pushViewport(vp)
grid.draw(p2)
upViewport()
如果你不熟悉grid
,你可以使用ggplot2
去完成類似的任務。
ggplot2
所有可以轉換爲grob
對象的圖形都可以使用as.ggplot
函數轉換爲ggplot
對象。
library(ggplot2)
p1 <- as.ggplot(~barplot(1:10)) +
annotate("text", x = .6, y = .5,
label = "Hello Base Plot", size = 5,
color = 'firebrick', angle=45)
p2 <- as.ggplot(expression(plot(rnorm(10))))
p3 <- as.ggplot(function() plot(sin))
p4 <- as.ggplot(~mosaic(Titanic))
p5 <- as.ggplot(densityplot(~mpg|cyl, data=mtcars))
圖形排列
現在有了ggplot
對象,我們可以利用cowplot
或者patchwork
包將所有的圖形組合起來。
library(cowplot)
library(colorspace)
col <- rainbow_hcl(3)
names(col) <- unique(iris$Species)
color <- col[iris$Species]
p6 <- as.ggplot(~plot(iris$Sepal.Length, iris$Sepal.Width, col=color, pch=15))
p7 <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width, color=Species)) +
geom_point(shape=15) + scale_color_manual(values=col, name="")
legend <- get_legend(p7)
## also able to annotate base or other plots using ggplot2
library(ggimage)
p8 <- p6 + geom_subview(x=.7, y=.78, subview=legend)
p9 <- as.ggplot(~image(volcano))
plot_grid(p1, p2, p3, p4, p5, p6, p7, p8, p9, ncol=3, labels=LETTERS[1:9])