Table of Contents
1 Mega畫樹的簡單應用
2 fas格式文件的準備
首先我們要準備的就是fas的需要進行畫樹的序列。這個自己根據需要生成。 我們用mega打開fas的文件，然後用mega進行格式轉換。Data->Export Al ignmetn->MEGA Format.
3 用生成的.meg畫樹
雙擊打開.meg文件。然後找到Phylogeny->Construct/Test Neighbor-Joi ning Tree->yes(use current data)->修改參數->Test of Phylogeny( Bootstrap method)->Na of Bootstrap Replication(1000)->Model/Me thod(p-distance)->Substitutions to Include(d:Transitions+Trans versions)->Gaps/Missing Data Treatment(Pairwise deletion).然後 Compute。很快就畫好了。
4 生出樹的處理
在畫樹完成以後，我們可以看到兩個圖，第一個叫做Original Tree 還有一 個是Bootstrap consensus tree。
4.1 修改內容，添加標註
這裏所有的修改都在view->Tree options中。
4.2 導出
在Image中中我們可以導出PDF或者PNG格式的圖片。
4.3 後面隨着學習的進行繼續修改，增加。
