主成分分析

 問題:假設在IR中我們建立的文檔-詞項矩陣中,有兩個詞項爲“learn”和“study”,在傳統的向量空間模型中,認爲兩者獨立。然而從語義的角度來講,兩者是相似的,而且兩者出現頻率也類似,是不是可以合成爲一個特徵呢?

       《模型選擇和規則化》談到的特徵選擇的問題,就是要剔除的特徵主要是和類標籤無關的特徵。比如“學生的名字”就和他的“成績”無關,使用的是互信息的方法。

       而這裏的特徵很多是和類標籤有關的,但裏面存在噪聲或者冗餘。在這種情況下,需要一種特徵降維的方法來減少特徵數,減少噪音和冗餘,減少過度擬合的可能性。

        PCA的思想是將n維特徵映射到k維上(k<n),這k維是全新的正交特徵。這k維特徵稱爲主元,是重新構造出來的k維特徵,而不是簡單地從n維特徵中去除其餘n-k維特徵。

         PCA計算過程:

    假設我們得到的2維數據如下:

     clip_image001[4]

    行代表了樣例,列代表特徵,這裏有10個樣例,每個樣例兩個特徵。可以這樣認爲,有10篇文檔,x是10篇文檔中“learn”出現的TF-IDF,y是10篇文檔中“study”出現的TF-IDF。

  第一步分別求x和y的平均值,然後對於所有的樣例,都減去對應的均值。這裏x的均值是1.81,y的均值是1.91,那麼一個樣例減去均值後即爲(0.69,0.49),得到

     clip_image002[4]

     第二步,求特徵協方差矩陣,如果數據是3維,那麼協方差矩陣是

     clip_image003[4]

     這裏只有x和y,求解得

     clip_image004[4]

     對角線上分別是x和y的方差,非對角線上是協方差。協方差是衡量兩個變量同時變化的變化程度。協方差大於0表示x和y若一個增,另一個也增;小於0表示一個增,一個減。如果x和y是統計獨立的,那麼二者之間的協方差就是0;但是協方差是0,並不能說明x和y是獨立的。協方差絕對值越大,兩者對彼此的影響越大,反之越小。協方差是沒有單位的量,因此,如果同樣的兩個變量所採用的量綱發生變化,它們的協方差也會產生樹枝上的變化。

     第三步,求協方差的特徵值和特徵向量,得到

     clip_image005[4]

     上面是兩個特徵值,下面是對應的特徵向量,特徵值0.0490833989對應特徵向量爲clip_image007[4],這裏的特徵向量都歸一化爲單位向量。

    第四步,將特徵值按照從大到小的順序排序,選擇其中最大的k個,然後將其對應的k個特徵向量分別作爲列向量組成特徵向量矩陣。

     這裏特徵值只有兩個,我們選擇其中最大的那個,這裏是1.28402771,對應的特徵向量是clip_image009[6]

     第五步,將樣本點投影到選取的特徵向量上。假設樣例數爲m,特徵數爲n,減去均值後的樣本矩陣爲DataAdjust(m*n),協方差矩陣是n*n,選取的k個特徵向量組成的矩陣爲EigenVectors(n*k)。那麼投影后的數據FinalData爲

     clip_image011[4]

     這裏是

     FinalData(10*1) = DataAdjust(10*2矩陣)×特徵向量clip_image009[7]

     得到結果是

     clip_image012[4]

     這樣,就將原始樣例的n維特徵變成了k維,這k維就是原始特徵在k維上的投影。

     上面的數據可以認爲是learn和study特徵融合爲一個新的特徵叫做LS特徵,該特徵基本上代表了這兩個特徵。

    上述過程有個圖描述:

     clip_image013[4]

     正號表示預處理後的樣本點,斜着的兩條線就分別是正交的特徵向量(由於協方差矩陣是對稱的,因此其特徵向量正交),最後一步的矩陣乘法就是將原始樣本點分別往特徵向量對應的軸上做投影。

     如果取的k=2,那麼結果是

     clip_image014[4]

     這就是經過PCA處理後的樣本數據,水平軸(上面舉例爲LS特徵)基本上可以代表全部樣本點。整個過程看起來就像將座標系做了旋轉,當然二維可以圖形化表示,高維就不行了。上面的如果k=1,那麼只會留下這裏的水平軸,軸上是所有點在該軸的投影。

     這樣PCA的過程基本結束。在第一步減均值之後,其實應該還有一步對特徵做方差歸一化。比如一個特徵是汽車速度(0到100),一個是汽車的座位數(2到6),顯然第二個的方差比第一個小。因此,如果樣本特徵中存在這種情況,那麼在第一步之後,求每個特徵的標準差clip_image016[6],然後對每個樣例在該特徵下的數據除以clip_image016[7]

     歸納一下,使用我們之前熟悉的表示方法,在求協方差之前的步驟是:

     clip_image017[4]

     其中clip_image019[6]是樣例,共m個,每個樣例n個特徵,也就是說clip_image019[7]是n維向量。clip_image021[4]是第i個樣例的第j個特徵。clip_image023[4]是樣例均值。clip_image025[4]是第j個特徵的標準差。

     整個PCA過程貌似及其簡單,就是求協方差的特徵值和特徵向量,然後做數據轉換。但是有沒有覺得很神奇,爲什麼求協方差的特徵向量就是最理想的k維向量?其背後隱藏的意義是什麼?整個PCA的意義是什麼?

 PCA理論基礎

     要解釋爲什麼協方差矩陣的特徵向量就是k維理想特徵,我看到的有三個理論:分別是最大方差理論、最小錯誤理論和座標軸相關度理論。這裏簡單探討前兩種,最後一種在討論PCA意義時簡單概述。

 最大方差理論

     在信號處理中認爲信號具有較大的方差,噪聲有較小的方差,信噪比就是信號與噪聲的方差比,越大越好。如前面的圖,樣本在橫軸上的投影方差較大,在縱軸上的投影方差較小,那麼認爲縱軸上的投影是由噪聲引起的。

因此我們認爲,最好的k維特徵是將n維樣本點轉換爲k維後,每一維上的樣本方差都很大。

     比如下圖有5個樣本點:(已經做過預處理,均值爲0,特徵方差歸一)

     clip_image026[4]

     下面將樣本投影到某一維上,這裏用一條過原點的直線表示(前處理的過程實質是將原點移到樣本點的中心點)。

     clip_image028[4]

     假設我們選擇兩條不同的直線做投影,那麼左右兩條中哪個好呢?根據我們之前的方差最大化理論,左邊的好,因爲投影后的樣本點之間方差最大。

     這裏先解釋一下投影的概念:

     QQ截圖未命名

     紅色點表示樣例clip_image037[14],藍色點表示clip_image037[15]在u上的投影,u是直線的斜率也是直線的方向向量,而且是單位向量。藍色點是clip_image037[16]在u上的投影點,離原點的距離是clip_image039[4](即clip_image030[4]或者clip_image041[4])由於這些樣本點(樣例)的每一維特徵均值都爲0,因此投影到u上的樣本點(只有一個到原點的距離值)的均值仍然是0。

     回到上面左右圖中的左圖,我們要求的是最佳的u,使得投影后的樣本點方差最大。

     由於投影后均值爲0,因此方差爲:

     clip_image042[4]

     中間那部分很熟悉啊,不就是樣本特徵的協方差矩陣麼(clip_image037[17]的均值爲0,一般協方差矩陣都除以m-1,這裏用m)。

     用clip_image044[10]來表示clip_image046[4]clip_image048[6]表示clip_image050[4],那麼上式寫作

     clip_image052[4] 

     由於u是單位向量,即clip_image054[4],上式兩邊都左乘u得,clip_image056[4]

     即clip_image058[4]

     We got it!clip_image044[11]就是clip_image048[7]的特徵值,u是特徵向量。最佳的投影直線是特徵值clip_image044[12]最大時對應的特徵向量,其次是clip_image044[13]第二大對應的特徵向量,依次類推。

     因此,我們只需要對協方差矩陣進行特徵值分解,得到的前k大特徵值對應的特徵向量就是最佳的k維新特徵,而且這k維新特徵是正交的。得到前k個u以後,樣例clip_image037[18]通過以下變換可以得到新的樣本。

     clip_image059[4]

     其中的第j維就是clip_image037[19]clip_image061[4]上的投影。

     通過選取最大的k個u,使得方差較小的特徵(如噪聲)被丟棄。

最小平方誤差理論:

  clip_image001

     假設有這樣的二維樣本點(紅色點),回顧我們前面探討的是求一條直線,使得樣本點投影到直線上的點的方差最大。本質是求直線,那麼度量直線求的好不好,不僅僅只有方差最大化的方法。再回想我們最開始學習的線性迴歸等,目的也是求一個線性函數使得直線能夠最佳擬合樣本點,那麼我們能不能認爲最佳的直線就是迴歸後的直線呢?迴歸時我們的最小二乘法度量的是樣本點到直線的座標軸距離。比如這個問題中,特徵是x,類標籤是y。迴歸時最小二乘法度量的是距離d。如果使用迴歸方法來度量最佳直線,那麼就是直接在原始樣本上做迴歸了,跟特徵選擇就沒什麼關係了。

     因此,我們打算選用另外一種評價直線好壞的方法,使用點到直線的距離d’來度量。

     現在有n個樣本點clip_image003,每個樣本點爲m維(這節內容中使用的符號與上面的不太一致,需要重新理解符號的意義)。將樣本點clip_image005在直線上的投影記爲clip_image007,那麼我們就是要最小化

     clip_image009

     這個公式稱作最小平方誤差(Least Squared Error)。

     而確定一條直線,一般只需要確定一個點,並且確定方向即可。

     第一步確定點:

     假設要在空間中找一點clip_image011來代表這n個樣本點,“代表”這個詞不是量化的,因此要量化的話,我們就是要找一個m維的點clip_image011[1],使得

     clip_image012

     最小。其中clip_image014是平方錯誤評價函數(squared-error criterion function),假設m爲n個樣本點的均值:

     clip_image015

     那麼平方錯誤可以寫作:

     clip_image017

     後項與clip_image019無關,看做常量,而clip_image021,因此最小化clip_image014[1]時,

     clip_image023 

     clip_image019[1]是樣本點均值。

     第二步確定方向:

     我們從clip_image019[2]拉出要求的直線(這條直線要過點m),假設直線的方向是單位向量e。那麼直線上任意一點,比如clip_image007[1]就可以用點me來表示

     clip_image025 

     其中clip_image027clip_image029到點m的距離。

     我們重新定義最小平方誤差:

     clip_image030

     這裏的k只是相當於iclip_image032就是最小平方誤差函數,其中的未知參數是clip_image034e

     實際上是求clip_image032[1]的最小值。首先將上式展開:

     clip_image036

     我們首先固定e,將其看做是常量,clip_image038,然後對clip_image027[1]進行求導,得

     clip_image039

     這個結果意思是說,如果知道了e,那麼將clip_image041e做內積,就可以知道了clip_image043e上的投影離m的長度距離,不過這個結果不用求都知道。

     然後是固定clip_image027[2],對e求偏導數,我們先將公式(8)代入clip_image032[2],得 

     clip_image044

     其中clip_image045 與協方差矩陣類似,只是缺少個分母n-1,我們稱之爲散列矩陣(scatter matrix)。

     然後可以對e求偏導數,但是e需要首先滿足clip_image038[1],引入拉格朗日乘子clip_image047,來使clip_image049最大(clip_image032[3]最小),令

     clip_image050

     求偏導

     clip_image051

     這裏存在對向量求導數的技巧,方法這裏不多做介紹。可以去看一些關於矩陣微積分的資料,這裏求導時可以將clip_image049[1]看作是clip_image053,將clip_image055看做是clip_image057

     導數等於0時,得

     clip_image058

     兩邊除以n-1就變成了,對協方差矩陣求特徵值向量了。

     從不同的思路出發,最後得到同一個結果,對協方差矩陣求特徵向量,求得後特徵向量上就成爲了新的座標,如下圖:

     clip_image059

     這時候點都聚集在新的座標軸周圍,因爲我們使用的最小平方誤差的意義就在此。

PCA理論意義:

   PCA將n個特徵降維到k個,可以用來進行數據壓縮,如果100維的向量最後可以用10維來表示,那麼壓縮率爲90%。同樣圖像處理領域的KL變換使用PCA做圖像壓縮。但PCA要保證降維後,還要保證數據的特性損失最小。再看回顧一下PCA的效果。經過PCA處理後,二維數據投影到一維上可以有以下幾種情況:

     clip_image060

     我們認爲左圖好,一方面是投影后方差最大,一方面是點到直線的距離平方和最小,而且直線過樣本點的中心點。爲什麼右邊的投影效果比較差?直覺是因爲座標軸之間相關,以至於去掉一個座標軸,就會使得座標點無法被單獨一個座標軸確定。

     PCA得到的k個座標軸實際上是k個特徵向量,由於協方差矩陣對稱,因此k個特徵向量正交。看下面的計算過程。

     假設我們還是用clip_image062來表示樣例,m個樣例,n個特徵。特徵向量爲eclip_image064表示第i個特徵向量的第1維。那麼原始樣本特徵方程可以用下面式子來表示:

     前面兩個矩陣乘積就是協方差矩陣clip_image066(除以m後),原始的樣本矩陣A是第二個矩陣m*n。

     clip_image068

     上式可以簡寫爲clip_image070

     我們最後得到的投影結果是clip_image072,E是k個特徵向量組成的矩陣,展開如下:

     clip_image074

     得到的新的樣例矩陣就是m個樣例到k個特徵向量的投影,也是這k個特徵向量的線性組合。e之間是正交的。從矩陣乘法中可以看出,PCA所做的變換是將原始樣本點(n維),投影到k個正交的座標系中去,丟棄其他維度的信息。舉個例子,假設宇宙是n維的(霍金說是11維的),我們得到銀河系中每個星星的座標(相對於銀河系中心的n維向量),然而我們想用二維座標去逼近這些樣本點,假設算出來的協方差矩陣的特徵向量分別是圖中的水平和豎直方向,那麼我們建議以銀河系中心爲原點的x和y座標軸,所有的星星都投影到x和y上,得到下面的圖片。然而我們丟棄了每個星星離我們的遠近距離等信息。

     clip_image075

總結與討論:

PCA技術的一大好處是對數據進行降維的處理。我們可以對新求出的“主元”向量的重要性進行排序,根據需要取前面最重要的部分,將後面的維數省去,可以達到降維從而簡化模型或是對數據進行壓縮的效果。同時最大程度的保持了原有數據的信息。

     PCA技術的一個很大的優點是,它是完全無參數限制的。在PCA的計算過程中完全不需要人爲的設定參數或是根據任何經驗模型對計算進行干預,最後的結果只與數據相關,與用戶是獨立的。 
但是,這一點同時也可以看作是缺點。如果用戶對觀測對象有一定的先驗知識,掌握了數據的一些特徵,卻無法通過參數化等方法對處理過程進行干預,可能會得不到預期的效果,效率也不高。

     clip_image076

     圖表 4:黑色點表示採樣數據,排列成轉盤的形狀。 
     容易想象,該數據的主元是clip_image077或是旋轉角clip_image078

     如圖表 4中的例子,PCA找出的主元將是clip_image077[1]。但是這顯然不是最優和最簡化的主元。clip_image077[2]之間存在着非線性的關係。根據先驗的知識可知旋轉角clip_image078[1]是最優的主元(類比極座標)。則在這種情況下,PCA就會失效。但是,如果加入先驗的知識,對數據進行某種劃歸,就可以將數據轉化爲以clip_image078[2]爲線性的空間中。這類根據先驗知識對數據預先進行非線性轉換的方法就成爲kernel-PCA,它擴展了PCA能夠處理的問題的範圍,又可以結合一些先驗約束,是比較流行的方法。

     有時數據的分佈並不是滿足高斯分佈。如圖表 5所示,在非高斯分佈的情況下,PCA方法得出的主元可能並不是最優的。在尋找主元時不能將方差作爲衡量重要性的標準。要根據數據的分佈情況選擇合適的描述完全分佈的變量,然後根據概率分佈式

     clip_image079

     來計算兩個向量上數據分佈的相關性。等價的,保持主元間的正交假設,尋找的主元同樣要使clip_image080。這一類方法被稱爲獨立主元分解(ICA)。

     clip_image081

     圖表 5:數據的分佈並不滿足高斯分佈,呈明顯的十字星狀。 
     這種情況下,方差最大的方向並不是最優主元方向。

     另外PCA還可以用於預測矩陣中缺失的元素。

參考文獻:

  tutorial on Principal Components Analysis LI Smith – 2002

     Tutorial on Principal Component Analysis J Shlens

     http://www.cmlab.csie.ntu.edu.tw/~cyy/learning/tutorials/PCAMissingData.pdf

     http://www.cad.zju.edu.cn/home/chenlu/pca.htm

 

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