Unix下編譯通過的C代碼,在win32下編譯是不能通過的 ,當然Unix 和win32的API都是符合標準C,也就是說,大多數函數調用在unix和win32下是相同的.但是,unix有自己一些獨特的API（如fork,spawn,signals,select,sockets等）,如果代碼中使用了這些API,在win32下當然找不到對應的庫.
但是,這些API的功能在win32中也能實現,也許你已經發現了一個能讓window編譯Unix風格代碼的方法:
1.修改編譯器,讓window下的編譯器把諸如fork的調用翻譯成等價的形式--這就是mingw的做法.
2.修改庫,讓window提供一個類似unix提供的庫,他們對程序的接口如同unix一樣,而這些庫,當然是由win32的API實現的--這就是cygwin的做法.
MinGW相比CygWin/gcc來講，更加貼近win32。因爲它幾乎支持所有的Win32API。它所連接的程序，不需要任何第三方庫即可運行。
CygWin/gcc，其實這是兩個東西。CygWin是一個讓Windows擁有Unix-like環境的軟件。而gcc就是安裝在CygWin上的編譯器。
CygWin/gcc與MinGW的最大區別在於：使用CygWin/gcc可以在Windows下調用unix-like的API，（如fork,spawn,signals,select,sockets等）。也就是說Cygwin是運行在Windows下的，但是她使用的是Unix-like系統的函數和思想。由於這個區別，導致的結果就是用CygWin/gcc編譯出來的程序可以無縫的運行在*nix環境下。但是如果調用了unix特有的API函數，在windows環境下不能正常運行，如果想在windows下正常運行的，就必須依賴cygwin1.dll，速度上會有些影響。
而用MinGW編譯出來的程序，如果源代碼裏面調用了unix環境的API，則MinGW會把這些對UNIX的API調用翻譯成win32下等價的形式。同時這個程序是不能在linux下運行的。
說白了，如果你是想在windows環境下開發linux運行程序，那麼CygWin/gcc是你的不二之選。
而如果你想開發的是windows運行程序，並且追求速度，那麼二者相比而言，MinGW是更好的選擇
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cygwin/gcc完全可以和在linux下的gcc化做等號，這個可以從boost庫的劃分中可以看出來端倪，cygwin下的gcc和linux下的gcc完全使用的是相同的Toolsets。
所以完全可以和linux一起同步更新gcc版本，而不用擔心問題，並且在cygwin/gcc做的東西（不用win32的）可以無縫的用在linux下，沒有任何問題。是在windows下開發linux程序的一個很好的選擇。但是在cygwin/gcc下編譯出來的程序，在windows執行必須依賴cygwin1.dll，並且速度有些慢，如果不想依賴這個東西的化，必須在gcc的編譯選項中加入-mno-cygwin。加入這個選項其實gcc編譯器就會自動的選擇在安裝cygwin/gcc時安上的mingw,這個mingw就是gcc的一個交叉編譯。
對於mingw作爲gcc在windows上的一個實現，由於不像cygwin的gcc在一個模擬linux上運行，同時相當一部分linux的工具不能夠使用，不過現在已經有Msys這個模擬unix的shell，可以解決很多的問題，不過沒有cygwin好用，而cygwin/gcc的no-cygwin選項又依賴於mingw的支持，所以更新的更慢的，現在只是到3.3.3。在mingw下也是可以升級gcc的，不過需要使用msys。升級方法和在cygwin和linux下差不多，就不再羅嗦了。不過就我的升級經驗來看好像都不太順利。具體深入的測試，我也沒有時間做了。
也是可以讓cygwin的最新安裝的gcc支持no-cygwin，需要再做一遍交叉編譯，但是我不會做，只好算了，呵呵，也許那一天我把這個搞定，再開一個貼吧。
根據以上的分析，如果在windows開發linux程序，cygwin是很好的選擇。如果你開發的程序不介意有一個cygwin1.dll的話，也是可以選擇cygwin的。如果你是想開發windows下的程序，還要必須用gcc的化，mingw是很好的一個選擇。但是在windows下有太多的編譯器了，bc，vc，intel c.....。
順便說就題外的化，據說gcc4.0.0性能有很大的提升，如果我升級完gcc4後，再編譯一把gcc4是不是以後的編譯性能會提高很多呢？有機會一定要測試一下了，呵呵。
一個技巧：如何知道當前版本的gcc的安裝配置，用命令：gcc -v就可以了，呵呵。