logP
logP值指某物質在正辛醇(油)和水中的分配係數比值的對數值。反映了物質在油水兩相中的分配情況。logP值越大,說明該物質越親油,反之,越小,則越親水,即水溶性越好。
TPSA 拓撲分子極性表面積
是常用於藥物化學的一個參數,其定義爲化合物內極性分子的總表面積,多爲氧原子及氮原子,也包括與其相連的氫原子。在藥物化學的應用中,極性表面積是評價藥物在細胞內的可運輸性質的描述指標。這一參數的大小與藥物在人體內的小腸吸收量、Caco-2單層可透性及血腦屏障的穿透性有明顯關聯。一例子是當一分子的極性表面積大於1.4平方納米時,其在細胞的穿透性就會變差。一種需穿越血腦屏障並作用於中樞神經系統的感受體上的藥物,其極性表面積就不能大於0.6平方納米。
Mr
相對分子質量的量符號爲Mr.,單位爲“1”。
相對原子質量(Ar) 是指以一個碳-12原子質量的1/12作爲標準,任何一種原子的平均原子質量跟一個碳-12原子質量的1/12的比值,稱爲該原子的相對原子質量。原子量爲質量單位,符號u,它定義爲碳12原子質量的1/12。
rdkit.Chem.Crippen module
Atom-based calculation of LogP and MR using Crippen’s approach
Reference:
-
- Wildman and G. M. Crippen JCICS _39_ 868-873 (1999)
rdkit.Chem.Crippen.
MolLogP
(*x, **y)
Wildman-Crippen LogP value
Uses an atom-based scheme based on the values in the paper:
-
- Wildman and G. M. Crippen JCICS 39 868-873 (1999)
Arguments
- inMol: a molecule
- addHs: (optional) toggles adding of Hs to the molecule for the calculation. If true, hydrogens will be added to the molecule and used in the calculation.
rdkit.Chem.Crippen.
MolMR
(*x, **y)
Wildman-Crippen MR value
Uses an atom-based scheme based on the values in the paper:
-
- Wildman and G. M. Crippen JCICS 39 868-873 (1999)
Arguments
- inMol: a molecule
- addHs: (optional) toggles adding of Hs to the molecule for the calculation. If true, hydrogens will be added to the molecule and used in the calculation.