2019已經與我們擦肩而過,響應jimmy號召,把總結提前到這兩天寫好。一份總結,可以從多個方面入手,工作的、學習的(一般也和工作內容相關的)、生活的,主要寫下學習方面的吧!
R語言和Python學習方面
想要入門一門編程語言真的要翻上好幾本書纔夠,因爲一本書的風格並不一定符合你的喜好和水平,可能讀完了沒有產生共鳴,提升不大。而且,只有把知識反覆看,相當於複習才能初步掌握嘛。雖然不必要每本書都買回來,圖書館借來讀下也是極好的。就拿今年的R語言學習來說吧,買來的《R語言實戰》和之前的實戰書系列讀得不明不白,中間間隔時間又有點長,反而是講量化投資的那本R語言書讓我有點茅塞頓開的感覺。這裏要說下技能樹贈送的《生物信息學講義》,R語言的知識點講的清晰明瞭,再次加深了這種感覺。雖然對於R語言還是在門口徘徊,但堅定了繼續翻幾本書將入門進行到底的決心。
從年初開始學習Shiny,針對最近幾年火熱消費級基因檢測,做了幾個簡單的小分析工具:我的shiny小站,開發自己的TCGA數據庫下載器就是怎麼簡單主要是把現成的R包(祖源的,HLA的等)加了個簡單的界面,練了練手,最開心的是有人使用。
上半年,新浪相冊停止服務了,新浪竟然只給一個包含全部相冊網址的xml文件,不得不說,真沒有大公司風範。於是,我爲了批量下載裏面的照片,用幾行python代碼實現了把xml文件裏的照片批量下載,並共享了下:新浪相冊下載小工具(方法應該已經過期了)。
工具方面:使用jupyter lab愉快地編程,aspera(ascp)在mac和win下的使用命令整理
生物信息學習方面
由於工作是微生物相關的,持續地關注了qiime2的更新動態,並順手翻譯了下:qiime2更新筆記。還有一些關於qiime2的學習筆記:qiime2+picrust1學習筆記,[翻譯]q2 picrust2 教程,將QIIME2學習進行到底。
跟着相關文獻探索了一下Nanopore測序儀測16S的可行性和數據分析流程Nanopore 16S數據分析學習筆記,後面R10芯片更新了,決定繼續追隨技術進步的步伐追蹤下去。
GWAS和多基因風險評分的學習纔剛剛進步,還處於離門很遠的階段,需要加強學習。PRS多基因評分教程學習筆記
其餘的便是工作中遇到的一些問題的解決和學習筆記了:
數字PCR學習筆記](https://jiawen.zd200572.com/1365.html)
生活方面
利用假期去了趟草原,感受了內蒙古中部草原的風光,欣賞下內蒙風光,順便畫了個大巴幾千公里的行進路線圖畫個草原之旅路線圖。
還有兩本書的讀書筆記,《基因組–人類自傳》讀書筆記和基因檢測之《生命的語言》讀書筆記
“玩電腦”
在閒暇時光裏,探索一下,各種不務正業,從app helloworld到給手機裝個linux當電腦。