一文掌握Kaplan Meier生存分析

Kaplan Meier,是一種單因素生存分析。它可用於研究1個因素對於生存時間的影響,在醫療領域中使用廣泛。

一、案例說明

當前某研究人員擬觀察一種新型癌症藥物的療效情況,首先將100名癌症患者隨機分成兩組,對照組使用傳統治療方式,實驗組使用新式藥物治療方式。並且隨訪時間爲2年。並且以‘是否死亡’爲作爲結局。希望通過研究瞭解到新式藥物是否對於生存時間帶來影響。

藥物組別:0代表傳統治療組;1代表新藥組。

生存狀態:0代表存活或失訪,1代表死亡。

生存時間:定量數據。

二、操作步驟

將數據上傳至SPSSAU平臺,選擇【實驗研究】--【Kaplan Meier】。

SPSSAU默認生存狀態中,用數字1代表死亡,0代表生存。

如果數據不是這樣設置,可以通過【數據處理】--【數據編碼】修改。

將[藥物組別]放入【X(定類)】,[生存時間]放入【Y1生存時間】,[生存狀態]放入【Y2生存狀態】。點擊開始分析。

Kaplan Meier

三、結果分析

1 模型基本描述

模型基本描述

上表是簡單描述數據基本情況。其中新藥、傳統治療分別有50個樣本。傳統治療組死亡43人;新式藥物組死亡44人。傳統治療組中位數爲9周,新藥組中位數爲65周,整體生存時間中位數爲24.5周。

特別說明一點,通常情況下感興趣的結局事情比例(事件佔比)一般希望大於20%。

2 生存時間估計

上表格爲Kaplan Meier模型得到的生存時間中位數估計值及其置信區間。由於生存時間的波動性,一般使用中位數表示整體情況(而不是使用平均值)。

從上表可知,整體研究病例生存時間估計值是36周,傳統治療的生存時間中位數是9周,但 ‘新式藥物’時中位數生存時間爲69周,明顯高於傳統治療時的生存時間。

注:中位數是與表中小於或等於 0.50 的第一個生存概率相關聯的時間。

3 假設檢驗

此處模型檢驗的原定假設爲:是否放入藥物組別兩種情況時模型質量均一樣。

從上表可知,模型拒絕原定假設(χ²=10.691,p =0.001 < 0.05),即說明本次模型構建有意義。

配對Log Rank檢驗用於分析兩兩組別生存時間估計值差異性。

從上表可知,模型拒絕原假設,P<0.05,說明兩組之間生存時間存在顯著性差異。

4 生存曲線

上圖可以明顯的看出,‘新式藥物’的生存率會明顯的高於‘傳統治療’方案。而且‘新式藥物’時,0~80周時生存率下降的幅度相對較小,但在80周後生存率下降幅度加大。‘傳統治療’方案來看,0~20周生存率下降非常明顯,20周後生存率下降幅度相對較爲穩定。無論如何,新式藥物的生存率都會明顯的高於傳統治療方案,整體說明,‘新式藥物’起着明顯的作用。

四、其他說明

(1)Kaplan Meier共有兩個因變量(一個是生存時間,另外一個是生存狀態);缺一不可。

(2)“生存狀態”項只能爲1和0; 1表示死亡,0表示生存;或者1表示陽性,0表示陰性;1表示放棄,0表示堅持,諸如此類等。數字1用於標識研究感興趣的結局事件已經發生。

(3)Kaplan Meier只研究1個因素的生存情況,如果有多個因素即多個X時,需要使用Cox迴歸

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