政治结构的变化
- 强化备边司职能：
* 以正统宰相为中心，针对国防问题展开临时性讨论的机构
→ 壬辰战争后，备边司成员扩充，主管事务逐渐蔓延到整个国政
→ 王权弱化，议政府与六曹机构开始变得有名无实
- 三司（司谏院、司宪府、弘文馆）的职能变化：
* 朋党利益关系的体现
→ 与其说是公论，不如说是重在维持己方势力以及牵制对方势力
- 铨郎权的滥用：
* 吏曹、兵曹铨郎拥有对中、下级官员的人事任免权
* 拥有推荐后任的权利（沈义谦、金孝元东西分党的肇始即源于此）
→ 铨郎任免人事同样首先考虑扩大己方势力，并罢黜对方势力
军事制度的变化
- 中央军的改编：
* 背景：16世纪以来，五卫[1]在军役的代立[2]制度下逐渐丧失其职能
→ 因壬辰战争初期的溃败，朝廷开始探索更有效的编制及军事训练方式
→ 设置训练督监（职业式的常备军）
* 增加军营：17世纪末确立五军营体制
→ 三军门：训练督监（1593）、御营厅（1623）、禁卫营（1682）
→ 首都外廓防御：总戎厅（1624）、守御厅（1626）
→ 成为西人派势力的军事力量基础
- 地方军的防御体系整改：
* 镇管[3]体制（朝鲜初期）
→ 《制胜方略》体系（16世纪以后）
→ 壬辰战争后恢复镇管体制；束伍军[4]诞生
[1] 朝鲜前期的中央军制，1566年五卫镇抚所改称五卫都总府，由中卫（义兴卫）、左卫（龙骥卫）、右卫（虎贲卫）、前卫（忠佐卫）、后卫（忠武卫）
[2] 指有军役或赋役义务的人，通过支付一定代价让他人替自己入役的行为。
[3] 朝鲜前期地方军事组织。在沿海要地设置镇，并组织有营镇军和骑船军以抵御外侵。
[4] 朝鲜后期（壬辰战争时）根据戚继光《纪效新书》中的束伍法，由两班、良人、公私贱人所编成的军队。平时各自从业生计，有需要时集结（如之后的丁酉再乱）。但由于两班等的逃避，常民及奴婢的负担变得更重。随着五军营制度的确立，束伍军变得可有可无。于是渐渐有了收米法：良人20斗、贱人10斗。英祖时期，良人从束伍军中除去，只留下贱人，结果在《续大典》中被称作“贱隶军”。