《禁閉島》講述了聯邦警官泰迪受命到一座島上調查一個殺人案件，卻因此遇到了重重危險和謎團的故事。電影有點燒腦，也有點血腥。
一名聯邦執法警官泰迪，和他的搭檔查克被派到禁閉島上來執行任務，調查一位失蹤的女精神病病患瑞秋，她曾親手殺害了自己的三個孩子。禁閉島上關押的都是精神病病患。泰迪除了執行調查任務，還有一個自己的私人目的，就是尋找殺害自己妻子的雷德斯。
隨着調查的深入，泰迪發現這座島上有很多祕密。他發現，除了自己要調查的瑞秋之外，還存在着第67位病患，可能被藏起來了，而這個人就是自己要找的雷德斯。
於此同時，泰迪總會做噩夢並出現幻覺，他會夢見自己作爲一名士兵時，進入集中營中看到的堆積如山的屍體，會夢見自己的妻子死於大火，而他無能爲力。
之後，他注意到島上的燈塔。泰迪開始聽到傳言，說島上在進行着不可告人的人腦實驗，實驗對象就是關押在島上的精神病病患。
最終，泰迪闖入了燈塔之中。他發現，燈塔中並沒有什麼人腦實驗，也沒有雷德斯，等待自己的只有院長考利醫師和主治醫生希恩。
原來，事實是這樣的：泰迪就是自己要找的那個雷德斯。雷德斯是一名二戰士兵，他夢中見到的情景，就是對曾經經歷的回憶，因爲他得了“二戰後遺症”。
二戰結束後，他回到美國做一名警官。有一天回家，雷德斯發現自己的妻子將三個孩子溺死在了家旁邊的湖裏。於是，他開槍打死了妻子，然後放火燒掉了房子。他變成了一個精神病患者，被關押在了禁閉島。
經過漫長的觀察和試驗，考利和委員會們決定開始下一步的行動——手術。泰迪問查克（也就是希恩）：怎麼樣比較糟？當一個怪物活着，或是當一個好人死去？ 說完，便朝着前來帶他去實驗室的醫護人員走去。
有段臺詞發人深省：我們的內心有暴力，這是人性。我們打仗、火燒祭品、殘殺我們的兄弟。爲什麼？因爲上帝要我們以他之名施暴。世上根本沒有道德秩序，只有這一點：我的暴力能征服你的暴力嗎？