侯君集，出身陝西，是北人。他家世不錯，是北周票騎大將肥城節公侯植之孫，侯定的第五子。
他早年就加入李世民旗下，是天策府一員猛將，深得主上信任。我們熟知的初唐大事件一一"玄武門之變"，李世民發動宮變，在玄武門誅殺兄長太子李建成和齊王李元吉。當時，侯君集就是政變的核心成員之一。
後來，李世民登基爲帝，年號定爲貞觀。在貞觀九年時，由於西北有政權叫吐谷渾［ tu yu hun ]，這個部落的大王叫慕容伏允，他拒絕向大唐朝貢。李世民便派軍隊征討。由我們熟知的老將李靖掛帥出征，侯君集也隨行出征。在這場戰役中，他克服自然困難追擊二千多裏地，先後於邏真谷、漢哭山、星宿川、柏海等大破伏允軍，斬獲頗豐，甚至追擊到積玉山，見到河水的源頭，纔回師與李靖在大非川會合，班師回朝。最終，吐谷渾政權被打服了，主動向唐朝投降，不肯朝貢的伏允自縊而死。這場戰爭樹立了大唐在西北各部中的威望，也向西擴大了大唐疆域的實際控制範圍。
如果說在平定吐谷渾戰役中，侯君集還只是隨軍，不是主帥。那麼在討伐高昌這場戰爭中，他就是當之無愧的首功。
侯君集這個人，雖然打仗很在行，但也的確缺少政治敏感。他埋怨李世民，卻不曾想過，跟隨李世民至今，又戰功累累，已有功高蓋主之嫌。如果他的功勞大到已經封無可封，將陷入被除掉的危險之中。但現在他犯事下獄，又輕易釋放，證明皇帝還是對他念有舊情，願意再次起用他。只要他保持謙遜，好好打仗，必能封妻萌子，永享榮華富貴。
可他卻非常不如好歹，和太子詹事張亮商議政事時，竟把心中謀反的念頭講了出來，並企圖拉對方入夥。張亮心中一驚，暗中將這件事密奏給李世民。
如果是其他的開國皇帝，如朱元璋之流，可能已把侯君集下獄治罪。但李世民覺得，侯君集只是嘴上說說，沒有實證，故沒有行動。這也從側面證明，李世民的確是仁君，非常有氣量。
可就在此時，李世民的家事也很動盪。他和自己的嫡長子李承乾之間的關係越來越緊張。李世民對太子李承乾的要求非常苛刻。早年長孫皇后在世的時候，父子關係還好一些。但後來隨着長孫皇后去世，父子兩人越發不對付。恰好這時，嫡次子李泰跳了出來，在朝堂上和李承乾爭寵。
自古以來，失敗的太子只有死路一條。恰巧，侯君集的女婿賀蘭楚石，就在李承乾的東宮內做官，而且還是李承乾的心腹。
在察覺到李承乾的心意之後，賀蘭楚石就把自父侯君集找了過來。侯君集一聽，李承乾要軾弟逼宮，這不就是玄武門之變的翻版嗎，他便信心滿滿地
宮，這不就是玄武門之變的翻版嗎，他便信心滿滿地答應了。就這樣，兩人一拍即合，共同決定，謀反篡位。
可惜的是，侯君集高估了李承乾。之前的玄武門之變，他身邊是長孫無忌，房玄齡這樣的高人，追隨的是李世民這樣雄才偉略的主上。李承乾的治國才能先不說，至少保密意識非常差。
當時就發生了這樣一件事。說來也巧，李世民的另一個兒子李佑，也因與父親李世民的關係緊張，決心在封地造反起兵了。李佑的這次謀反，無論是從當時，還是今天來看，都是非常搞笑的。首先，他手下只是招募了一些兵士，其次，這次的謀反水平甚至未等朝廷派兵，李佑就已經被當地的軍曹拿下了。最終，李佑被賜死。
可問題在於在審訊李佑同黨期間，審查官員偶然查到了一個叫幹承基的人。而這個人恰好是東宮的官員，還是李承乾的心腹。紇幹承基被抓之後，就把李承乾謀反的計劃全盤托出。
就這樣，侯君集和李承乾一起下了詔獄了。侯君集犯叛國罪，按唐律，謀反屬於十惡之最，應立即處斬。但到了這個份上，李世民仍然想保侯君集一命。可惜他的女婿賀蘭楚石還供出了謀反的鐵證，羣臣力爭以法處置。
李世民給了侯君集最後的體面，他親自來到詔獄，和
侯君集說：我不想讓刀筆吏折辱您。一代明君，給自己的追隨多年的功臣留足了面子和尊嚴。