原创 生物專業領域有哪些問題可以用python來解決呢?
一 、下面是一些自己之前遇到的可以用python處理的生物學問題，僅供參考。 1、fasta和fastq格式之前的互相轉化 2、根據基因ID從fasta文件中提取序列序列 3、比對後的fasta格式轉化爲phylip格式 4、提取
2020-06-15 16:21:30
原创 目前高分子材料工程領域存在哪些科研難題？
高分子材料幾乎可以應用於材料學研究範疇的各個領域，每個材料學中未能解決的問題都可以歸入高分子材料亟需解決的問題。因爲了解一些關於大分子自組裝領域的知識， 以此爲例粗答一下：大分子自組裝就是將高分子（均聚物或嵌段共聚物）通過分子作用
2020-06-15 16:21:30
原创 使用HPC進行生物醫學建模的實際挑戰
精準醫學的基本概念是通過了解個體患者特徵的影響，可以改善癌症等病理的預防，診斷和治療。預測醫學尋求通過機制模型得出這種理解，該模型描述了特定個體內疾病的原因和（潛在的）進展。這代表了計算生物醫學的巨大挑戰，因爲它需要將高度變化的（
2020-06-15 16:21:30
原创 如何用make構建LAMMPS
1、構建LAMMPS與傳統的makefile需要你有一個 Makefile.文件適用於您的系統無論是在 src/MAKE，src/MAKE/MACHINES，src/MAKE/OPTIONS，或 src/MAKE/MINE目錄（見
2020-06-15 16:21:30
原创 用Python模糊匹配處理人工數據的匹配
生物信息處理一些經過人工輸入的數據，往往有少量的錯誤。但是這些元數據往往要與結果數據統一分析，且非常之重要。數據量小，那就一個一個改吧，如果太多了，杯具了, 怎麼辦？ 工作需要寫了一個python小函數，用fuzzywuzzy模糊
2020-06-15 16:21:30
原创 玩轉遍歷樹
本書不是一本關於Python編程的書，因爲主題太廣泛了。話雖如此，但對於Python的入門書籍來說，詳細討論遞歸編程並不常見；而遞歸編程技術通常很適合處理樹；遞歸編程也具有函數式編程語言風格的通用編程策略，在執行並行開發時非常有用
2020-06-15 16:21:30
原创 Matlab機器人工具箱機械手建模
根據上述機械手各關節的D-H參數，利用工具箱中的Link函數創建機械手各連桿；然後利用SerialLink函數把獨立的關節組合起來創建機器人對象。Link函數的調用格式爲： L（i）=Link( [theta，D，A，alpha，
2020-06-15 16:21:30
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原创 基於結構的藥物設計：從分子對接到分子動力學
近年來，計算機輔助藥物設計（Computer-Aided Drug Design，CADD）方法在藥物研發中不斷嶄露頭角，如已批准上市的卡託普利、沙奎那韋、利托那韋和茚地那韋等，其早期研究大大受益於CADD方法。CADD已成爲藥物
2020-06-15 16:21:30
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原创 使用MATLAB Profiler提升程序運行的效率
很多同學在研究和學習的過程中都會經常使用 MATLAB。很多時候當編好一個程序之後，我們發現程序運行的效率達不到預想的要求。盲目的去找程序的缺陷往往既花時間也沒有什麼太大效果。這裏我想告訴大家 MATLAB 很重要的功能 – Pr
2020-06-15 16:21:30
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原创 LAMMPS應用：LAMMPS模擬衝擊壓縮
衝擊波通常是由爆炸或宏觀物體的高速碰撞產生的，如炸藥爆炸，高速彈丸穿甲，隕石撞擊等。衝擊波作用下材料在極短時間內發生塑性形變、熔化或化學反應等本質上不可逆的變化。衝擊載荷相關的空間尺度（如晶格層次形變）和時間分辨率（皮秒至飛秒量級
2020-06-15 16:21:30
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原创 如何在Windows上構建LAMMPS
1、LAMMPS主要在Linux機器上開發和測試。 3、使用移植到Windows的GNU GCC 4、使用交叉編譯器
2020-06-15 16:21:30
原创 生物醫用支架的形變仿真分析
生物醫用支架改善患者生活質量 動脈粥樣硬化的一種常見治療方法是經皮腔內血管成形術，這種手術可以清除或抑制患者冠狀動脈中積聚的多餘斑塊。在一些情況下，手術必須使用支架，而支架利用了血管成形術的球囊，將自身固定在動脈的堵塞部位。 支架
2020-06-15 16:21:30
原创 分子模擬榨乾GPU性能的參數建議
顯卡加速自從在分子模擬開始使用以來，大大加速了分子力學的模擬速度，引sob大提到的觀點“一個家用高端四核處理器加上一張消費級顯卡（如RTX2060）就可以超過20核雙路服務器”。 這裏給出一些關於分子模擬如何最大化使用顯卡加速的建
2020-06-15 16:21:30
原创 生物醫學材料的分類
生物醫學材料是指一類具有特殊性能、特種功能，用於人工器官、外科修復、理療康復、診斷、治療疾患，而對人體組織不會產生不良影響的材料。現在各種合成材料和天然高分子材料、金屬和合金材料、陶瓷和碳素材料以及各種複合材料，其製成品都已經被廣
2020-06-15 16:21:30