原创 Spyder: 一款優秀的Python 數據科學開發環境

個人感想 看到Udemy中機器學習的教程,講師用的是Rstudio操作的R,用的是Spyder操作的Python,驚豔了我。決定學習一下這個編輯器的操作,做一下記錄。 1. Spyder編輯器介紹 Spyder是一個強大的科

原创 R語言統計一個程序運行時間的函數system.time

使用system.time,如果裏面用的是一個程序,那就用大括號{}括起來! 使用方法: a = 1+1 system.time({a = 1+1}) 注意: 程序要在{}裏面。 > system.time({a = 1+1})

原创 vscode連接服務器報錯: could not establish connectionto Name_sever.Connecting was canceled

報錯類型 報錯原因: 這種錯誤,主要是vscode設置的服務器信息和實際的服務器信息不一致導致的,服務器的名稱要一致,IP要一致,用戶名要一致。所以我們修改vscode的vscode配置文件config 解決方案: 1,再打開一

原创 如何關掉 vscode的服務器終端名稱

首先運行快捷鍵: ctrl + shift +p 找到config設置 在文件中把無關的服務器信息刪掉即可。

原创 由火車站戴口罩人臉識別入站感想

由火車站戴口罩人臉識別入站感想 個人經歷 過完春節,去上班,疫情還很嚴重,火車站機器安檢,需要摘下口罩刷身份證纔可以安檢成功,在摘下口罩的那一刻,慌得一批。 最近經歷 最近又坐火車,還是機器安檢,這時候疫情基本控制,準備從容的摘到

原创 筆記 GWAS 操作流程4-2:LM模型linear+數值協變量

1. 協變量文件整理 第一列爲FID 第二列爲ID 第三列以後爲協變量(注意,只能是數字,不能是字符!) 這裏協變量文件爲: [dengfei@ny 03_linear_cov]$ head cov.txt 1061 1061

原创 筆記 | GWAS 操作流程4:LM模型assoc

1. GWAS筆記操作計劃 之前的教程中,我們使用的是別人模擬的數據,數據類型是二分類數據,這裏我們模擬一個數量性狀的連續性狀,做GWAS更有代表性。 我們先從沒有協變量的一般線性模型(LM)模型開始,然後加入數據類型的協變量,然

原创 經常編程的人搜狗輸入法設置建議

默認是英文的 這樣不用來回切換中文字符,否則打開一個新的界面,或者瀏覽一下網頁,然後進入編程時,都要切換爲英文的。 另外,很多東西建議使用英文的單詞搜索,拼音搜索也可以找到一些結果。 我的設置如下: 設置完的效果: 搜狗輸入法,

原创 你什麼時候感覺自己的編程突飛猛進的?

學習生涯 回想我自己的學習R語言的經歷,總結如下: 1. 敲門 第一級:跑別人的代碼 2. 入門 第二級:修改別人的代碼,安裝包 3. 晉級 第三級:查看包中幫助文檔,自己寫代碼 4. 突飛猛進 第四級:根據自己的需

原创 Linux 將zsh 變爲 bash默認

嚐鮮一時爽,回頭火葬場 前幾天嘗試了zsh,風格很炫酷,但是目錄切換以及目錄提示太過溫馨,讓我懷念起bash的簡樸,我就想回到bash。 雖然我知道,bash直接就可以回到,但是我不想默認zsh了。 1. 卸載zsh 離別的話:和

原创 asreml 4r 報錯

1. 報錯信息 示例代碼: library(asreml) data("harvey") head(harvey) ainv = ainverse(harvey) head(ainv) m2 = asreml(y3 ~ Line,

原创 R語言中如何退出程序 類似python的sys.exit函數?

R中使用return(message("")) 例子: tt = function(dat){ # 判斷如果數據的列數爲3列,就退出,給出提示,如果是其它列,打印數據前六行。 if(dim(dat)[2] == 3){

原创 Error in data.table data vv lapply vv functionx eval parse text = x

asrmel4r報錯截圖: Error in `[.data.table`(data, , `:=`((vv), lapply(vv, function(x) eval(parse(text = x), : Supplie

原创 R 語言 將因子轉化爲虛擬變量

1. 背景 在迴歸分析時,有時候我們需要知道每個因子每個水平的迴歸係數,這樣就需要將因子轉化爲虛擬變量,R語言中有model.matrix進行轉換,但是隻能一個轉換一個因子,這裏我們用R包useful,可以支持多個因子同時轉換。

原创 遺傳評估分析之模板文章

1. 參考文獻 伊犁馬體尺性狀非遺傳因素分析及遺傳參數估計[J]. 畜牧獸醫學報, 2017(10). 2. 試驗數據描述 研究所用數據取自伊犁某2個規模化養馬場及參加伊犁馬常態化賽事參賽馬匹。數據中的體尺指標包括體高(體長