原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 6 生信分析流程批量運行與過程控制

前文鏈接: 圖形化開放式生信分析系統開發 - 1 需求分析及技術實現 圖形化開放式生信分析系統開發 - 2 樣本信息處理 圖形化開放式生信分析系統開發 - 3 生信分析流程的進化 圖形化開放式生信分析系統開發 - 4 生信分析

原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 2樣本信息處理

一、基於生信分析雲平臺的需求,在下圖中可以看出樣本信息在整個軟件中的作用 樣本信息用於數據拆分、運行運行流程、分析報告,是整個系統的基礎數據之一。 下面來具體歸納一下樣本信息在軟件系統的作用並列出詳細的數據字段: 1、用於標記分析運行狀

原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 9 Illumina測序儀測序數據自動拆分

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原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 5 生信分析流程服務器端運行

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原创 圖形化開放式生信分析系統開發- 1基本需求分析及技術實現

圖形化開放式生信分析系統開發- 1基本需求分析及技術實現起因/背景幾張圖片下面進入正題,以具體個人工作經歷爲例,分析歸納出需求:實踐問題一,圖形化替代命令行腳本交互實踐問題二,解決遷移部署問題實踐問題三,解決環境搭建、軟件安裝問題

原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 8 軟件穩定性測試

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原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 7 分析報告的模板定製與自動生成

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原创 使用docker完成生信分析環境搭建

生信開發人員最頭疼的問題,可能就是平臺搭建和軟件安裝了。部署和遷移上要費很大力氣。本文講述使用docker製作一個鏡像,後續通過導入自己定製的鏡像,複製文件完成分析流程的部署和遷移。 如何使用docker,推薦閱讀 Docker

原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 4 生信分析流程圖形化設計

前文鏈接: 圖形化開放式生信分析系統開發 - 1 需求分析及技術實現 圖形化開放式生信分析系統開發 - 2 樣本信息處理 圖形化開放式生信分析系統開發 - 3 生信分析流程的進化 在上文圖形化開放式生信分析系統開發 - 3

原创 圖形化開放式生信分析系統開發 - 3 生信分析流程的進化

接上兩篇內容,本文主要講述工作中NGS從科研進入醫學臨牀領域,工作中接觸到生信流程,以及最終在自動圖形化開放式生信分析系統開發中生信workflow設計實現的過程。 接觸二代測序,生信分析,那真是打開了一個新世界的大門,各種名次術