计算MiRNA–mRNA表达相关性

看到一篇文章提到了这个分析,作者下载了TCGA数据库的OV的Affymetrix HT HG-U133A arrays, n = 598表达矩阵和Agilent 8 × 15 K Human miRNA-specific microarray的表达矩阵。

使用 Maximal Information Coefficient (MIC) 这个算法来计算计算MiRNA–mRNA表达相关性,这个算法来自于文献:D. N. et al. Detecting novel associations in large data sets. Science 334, 1518–1524 (2011).

感兴趣的朋友可以看看这个算法的实现,肯定不是普通的皮尔森相关系数啦。

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