Rootkit病毒是一類特殊的病毒，其最大的特點是“隱形”。採用Rootkit技術的病毒，雖然存在於系統中，但是通常情況下病毒文件本身是被隱藏起來的，根本無法通過資源管理器及各種普通的文件管理工具查看到。典型的Rootkit木馬病毒，有著名的“Hxdef100”“C.I.A.”，國內的“AFXRootkit”“黑客之門”等。Rootkit木馬可以在目標主機上將自身程序進行隱藏，同時隱藏進程、註冊表鍵值、開放的網絡端口等，也就是說此類木馬可以將與自身有關聯的任何蛛絲馬跡都隱藏起來，傳統的殺毒方式無法查到。
