【已解決】通過PMID或PMCID下載sc-Seq基因數據集

PMID和PMCID的區別在於編號的系統不一樣,PMID是PubMed爲每一篇文獻給予的特定編號,而PMCID是PMC爲每一篇文獻給予的特定編號。有PMID號碼的文獻一定會有PMCID號碼,而有PMCID號碼的文獻並不一定有PMID號碼。

在 PubMed 查詢文獻的時候,經常會看到PMID和PMCID號碼,而有的文獻只有PMID號碼,而沒有PMCID號碼。兩者之間有何區別和聯繫?興趣驅使,研究了一下。

PMID

PMID是NIH(National Institutes of Health ,美國國立衛生研究院)爲PubMed搜索引擎中收錄的文獻的一個編號。PMID的作用類似於書籍的國際標準書號(ISBN),或者人的身份證,每一篇文獻對應的一個PMID號碼,通過PMID號碼我們就可以找到唯一對應的文獻。

PubMed 收錄了多少文獻,就有多少PMID號碼。因此PMID號碼會一直增加下去。

我們可以在 PubMed 查詢一下,PMID號碼爲1的是一篇1975年發表於Biochem Med的文獻:Formate assay in body fluids: application in methanol poisoning。作者是Makar AB。

那是不是 PubMed 收錄的最早的文獻就是1975年的?事實並不是如此,在PubMed上可以查到1950年的文獻,比如這篇:AYRES JC , FEEMSTER RF. Serologic tests in the diagnosis of infectious diseases. N Engl J Med. 1950 Dec 28;243(26):1034-43. 但是它所對應的PMID號碼是:14785777。

具體怎麼編碼的我想應該是從1975年文獻就開始電子化了,或者1975年PubMed成立,就從當年的文獻開始編號PMID。而之前的文獻是經過電子化後又後來編入的,因此PMID號碼就大。另外一個原因可能是MEDLINE只收錄了1975年以後文章,PubMe根據隨MEDLINE的文獻進行編號。而1975年以前的文獻是逐步加入的。但是具體原因我不清楚,只是猜測而已。

迄今爲止,PMID號碼已達8位數,打頭數字是2。

如果知道PMID號碼,可以直接在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed中直接輸入PMID號碼就可以查詢,或者是PMID號碼[UID]的形式查詢。

PMID在 EndNote 中有大用處,可以方便的找到文獻。這個將來再說。

PMCID

PMCID(PubMed Central reference number)是PubMed中心爲文獻歸檔號碼。PubMed中心簡稱PMC,是收錄免費文獻的地方。在PMC查詢到的文獻都是Open Access,即免費獲取。因此,如果一篇文獻提交給PMC都要提供電子全文。PMC爲這些文獻進行編號,即PMCID。

同樣,在PMC (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc)可以直接利用PMCID查詢到特定的文獻。

不過,在PMC查不到PMCID爲1的文獻,甚至100也沒有,多了我沒試。

PMID和PMCID的區別

因此我們看出,PMID和PMCID的區別在於編號的系統不一樣,PMID是 PubMed 給予文獻的編號,而PMCID是PMC給予文獻的一個編號。兩者都是文獻的身份證。

正如一個人可以同時持有中國身份證和美國綠卡一樣。

但是有PMID號碼的文獻並不一定有PMCID號碼,一般只有免費全文Open Access的文獻纔有PMCID。相反,我個人認爲,有PMCID號碼的一定會有PMID號碼。

PMID和PMCID之間的轉換和查詢可以通過這個:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/pmctopmid/

參考文章:http://www.howsci.com/pmid-pmcid.html

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