我們已經知道要分析的數據對每個基因有3個重複測定值，經過缺失值填充後，每個基因都有3個可用值。
這一步很簡單，就是取這3個值的中位數，即median。
方法很多，在excel中可以用median函數;
在R中以下代碼進行操作：
get_median<-function(i,j){
num_vec<-c(imputeddata[i*3-2,j],imputeddata[i*3-1,j],imputeddata[i*3,j])
median(num_vec)
}
#A simple function to calculate median value of three replicates
dimrow<-(dim(imputeddata)[1])/3
mediandata<-matrix(data = NA, nrow =dimrow, ncol = dim(imputeddata)[2], byrow = TRUE, dimnames = NULL)
#Create a blank matrix to store median values
for (i in 1:dimrow){
for (j in 1:dim(imputeddata)[2]){
mediandata[i,j]<-get_median(i,j)
}
}
#Assign median value using the function get_median()
現在我們得到了中位數的數據，儲存在mediandata對象裏，行數是缺失值填充數據imputeddata的1/3，double check一下：
> dim(imputeddata)
[1] 11571 20
> dim(mediandata)
[1] 3857 20