知道這本書是一個偶然的機會，那段時間正好在研究免疫細胞比較厲害的團隊工作（忝列門牆啊），自然想找點資料來擴充一下自己的知識面，以便知道T細胞到底有幾個正宗的亞羣。如張老師對T細胞的劃分：
文獻既視感：
幾乎做到了一個marker一個亞羣的地步，實在是厲害了。而我對T細胞的十大古老家族還不清楚，知不足而後勇啊，不得不補一補T細胞的歷史。於是，就打印了這本《T-Cell Differentiation》。這是2017年出版的關於T細胞研究的實操類書籍。
說它是實操類的因爲裏面涉及大量的實驗規程，第一步加什麼，第二步加什麼。這對我這個做數據分析的人來講是有點陌生的。單說這部分實驗，目前還是有不少借鑑意義的。如何設計抗體來calling目標細胞，分離細胞後如何分析。理解了流式細胞術的應用，也就不難理解爲什麼傳統做單細胞的老師爲什麼那麼在意亞羣細胞的佔比以及表達量到底是陰還是陽。因爲這些概念基本是基於細胞表面抗原的這套體系建立起來的。
高通量單細胞測序時代，基於表面抗體的技術可以淘汰了嗎？打個不恰當的比喻，細胞表面抗體的這套技術就像人們說的以貌取人，scRNA測的是人的美麗心靈。心靈不管多麼美麗精巧，人還是會看外表。之前的時代只看臉固然不對，但是隻看心靈也有失偏頗。表面蛋白依然是細胞身份的重要表徵，因爲很長一段時間內，細胞身份就是靠這個來定義的。
書中討論了 Naïve / Memory Cells / T Helper Cell / Antigen-Specific T Cell Exhaustion / Regulatory T Cells /γδ T Cells 等T細胞的捕獲分選方法，也討論了基於NGS的單細胞microRNA / Long Noncoding RNAs 分析方法。值得一提的是，書中還給出了scRNA分析的流程（Smart-seq），堪稱經典。
這一節書中列出了scrna常用的分析工具，可見自那時起（2017年），單細胞轉錄組數據分析的工具已經完備了。
對每一種細胞亞羣的印象，在閱讀的過程中清晰過也迷惘過。清晰的是原來他們之間是這樣區分的，迷惘的是隻是靠幾個marker就可以推斷其功能嗎？當然，我們知道很多細胞亞類有着相同的表面marker但是卻行駛着不同的功能。一方面是我們的marker總是有限的，另一方面是每個一marker背後都有一箇中心法則。
TCR或BCR是不穩定的體細胞，在正常的體細胞內一般受精後DNA不再變化，但是TCR和BCR的DNA序列是變化的：體細胞DNA重組形成新的功能基因。這是不同人之間的TCR或BCR的克隆型差異巨大的主要原因，也是T細胞或B細胞如此豐富多樣的原因。
到目前爲止，認識細胞類型的過程基本就是認識marker（基因的或蛋白的）的過程。細胞是什麼就像在問一個人是什麼一樣，身高不是人，性格不是人，身份不是人，可是這些可以描繪人。但是這些標籤總是靜止的，而T細胞是在免疫過程中定義的，他們的名字很清楚：Naïve / Memory Cells / T Helper Cell / Antigen-Specific T Cell Exhaustion / Regulatory T Cells /γδ T Cells，雖然也有叫做CD4T / CD8T 的。細胞的名稱就像代碼中的變量名一樣，應該是有意義的，而不只是個標籤。