原创 【陪你學·生信】八、序列兩兩比對的理論和操作
今天介紹DNA或蛋白質序列的兩兩比對（pairwise comparisons），除了具體操作，還加入了一些理論知識。通過比對可以確定兩序列是否同源，找到序列中的結構域，比較基因及其產物等，從而獲得序列中的功能、結構、進化等信息。這次內容
2020-11-19 15:09:15
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原创 【野生小科普】疫苗有效性90%是什麼概念
目前有10款疫苗已進入III期臨牀階段，未來幾周我們會看到更多新冠疫苗的研究進展。近日，輝瑞和BioNTech公司合作的基於mRNA的新冠候選疫苗BNT162和俄羅斯的基於病毒載體的新冠候選疫苗Sputnik-V的三期臨牀結果都顯示這兩支疫
2020-11-13 00:31:38
原创 【現學現賣·碩博】關於回覆審稿人意見的意見
常見的審稿人意見1. 語言問題Poor language usage, which made some sections very difficult to understand. The paper suffers from poor E
2020-11-13 00:31:38
原创 【野生小科普】碳中和
10月19號在《Nature》網站有一條關於中國承諾在2060年之前實現碳中和目標的討論。下一週的26號，同一個網站發表對歐盟承諾2050年實現碳中和目標的質疑。近年關於碳中和的事件梳理如下，小科普一下：全球碳中和進程2015年12月，各國
2020-11-04 00:07:37
原创 【野生小科普】實驗室的大腦
上一篇推送（【野生小科普】實驗室中的細胞）中提到的海拉細胞系，在網上能找到很多涉及生物材料倫理道德問題的報道，我覺得主要討論點是源自醫生取用組織時沒有走正規流程，家屬也沒有及時收到消息和補償。她的細胞爲醫學做出很多貢獻，然而家人早期連健康保
2020-11-02 15:08:09
原创 【野生小科普】實驗室中的細胞
海拉細胞（HELA）10月29日，霍華德·休斯醫學研究所（HHMI）向海麗埃塔·拉克絲基金會（Henrietta Lacks Foundation）捐贈六位數資金（目前收到的最多的一次捐款）。除了HHMI，也有一些企業或個人向基金會捐款。看
2020-11-02 00:06:39
原创 【陪你學·生信】七、在數據庫中檢索相似的序列
一、相似度Similarity序列的分析離不開相似度這個指標，相似度比較高的序列往往具有相似的結構、執行相似的功能。所以用未知序列blast得到的結果可以對未知序列進行推測。當兩個序列非常相似時，生物學家稱之爲同源。然而有一點不明確，就是什
2020-10-28 00:07:45
原创 【野生小科普】孤獨的地球人
前段時間看到報道說人們發現了金星大氣層中存在磷化氫（PH3），這意味着金星上可能存在生命。爲什麼磷化氫能引起人們這麼大的重視？這是因爲它通常是由厭氧生物代謝產生的，一般不會在非生命的自然活動，比如雷電和火山爆發中大量生成。金星大氣中磷化氫濃
2020-10-26 15:08:09
原创 【野生小科普】生物技術——現代科學送給被害人的禮物
前日（2020.10.14日）看到南京市中級人民法院決定對“南醫大女生遇害案”的兇手執行死刑。這起28年前的案子終於塵埃落定（兇手是今年2月抓到的，前日判決），除了想說“正義不會缺席”這句老話外，公安機關多年執着追兇以及證據收集和檔案管理的
2020-10-26 15:08:09
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原创 【陪你學·生信】六、當你有一段待分析的氨基酸序列
這一推送將簡單介紹：1. 尋找蛋白質結構域2. 簡單預測序列的理化性質4. 預測蛋白酶降解位點5. 預測捲曲螺旋區域（coiled-coil domains）6. 預測翻譯後修飾再介紹之前說過的網站，這一章會用到很多次：ExPASyhttp
2020-10-16 09:37:30
原创 【野生小科普】阿爾弗雷德·諾貝爾和今年獲獎的科學研究
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MzU2Mjc1OA==&mid=2247485540&idx=1&sn=d8e93fbd7773b15e8d1c0d51505d84d6&chksm=eb898e0
2020-10-10 01:46:06
原创 【陪你學·生信】五、當你有一段待分析的DNA序列
這一推送將介紹當你測序得到一段DNA序列後，可能會用到的基礎操作。一、拿到序列結果後，首先剔除可能的錯誤一般送測序的樣品往往經歷純化，克隆，轉化等操作。期間不可避免會混有不是目標序列的片段。可能來自於載體，也可能是操作中的污染。爲了避免浪費
2020-10-06 15:27:35
原创 【野生小科普】森林防火員——河狸
之前給大家介紹過山火時期天空的顏色爲何是紅色（【野生小科普】在“火星”醒來？）。近年頻發的，不斷刷新紀錄的一系列大型山火，使人們有了緊迫感，去研究這一系列山火發生背後的種種。山火，是森林每年發生的自然現象，一般規模較小。健康的森林需要週期性
2020-09-26 15:27:21
原创 【陪你學·生信】四、蛋白質相關的數據庫
一、簡單說蛋白質合成對蛋白質提取和測序比DNA的操作貴，一般大家先分析核苷酸序列，推測ORFs，機器翻譯出蛋白質的氨基酸序列。但是研究蛋白質的科學家覺得這個方法並不可靠。因爲一個成熟蛋白質的aa鏈需要經過很多修飾（切割、水解、甲基化等化學修
2020-09-26 01:44:43
原创 【野生小科普】我們從未如此瞭解它（1）
每次看到一些關於恐龍的研究進展，就想寫一篇推送彙總一下。我童年記憶中的恐龍對恐龍充滿的好奇和喜愛，大概源自於小時候和表弟一起看的那些有圖的書裏，它們的圖畫最特別。記得我們倆有很精緻的恐龍模型，我的是雷龍，他的是劍龍。一堆塑膠的塊塊放在一個蛋
2020-09-20 15:28:16