医学图像预处理

图像预处理:

  • 将CT图像灰度数值转为HU值,HU值指的是人体组织器官对辐射的透光性,越是不透光,值越高,比如骨头的值就非常高。这里附一张HU值表,里面有常见的组织器官的透光性。顺便说一句,LUNA16的数据已经处理成HU值,真是很人性化了。
  • 生成mask,这一步的处理方法我看过两种,一种训练一个分割网络,然后对每张切片进行分割,另一种是阈值化,第二种更简单些,我倾向于使用第二种,这也是DSB2017第一名的方案。下面就说一下方案二,阈值化采取的阈值不是随便定的,这里采取-600,这样水,空气基本就被过滤掉了,剩下的部分,进行以下膨胀处理,将肺部内部的小孔洞填上,这样,一张mask就完成了,简洁高效。
  • 归一化,首先将所有体素的值截取到-1200 ~ 600这个范围,小于-1200的设为-1200,大于600的设为600,然后再缩放至0~255,最后再加上mask。

参考文章:
关于图像特征提取
医学图像的特征提取
医学图像了解

模式识别之特征提取算法
pyradiomics

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