正八經的官網： https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool
注：windows、redhat、ubuntu、mac的都可以下載使用
windows用戶安裝使用
windows用戶，下載的是一個gdc-client.exe文件
1.存放exe與txt
例如，我隨便找一個文件夾，文件夾地址是：E:\workspace\gdc，我把源文件（txt）與客戶端exe放在如下：
[外鏈圖片轉存失敗,源站可能有防盜鏈機制,建議將圖片保存下來直接上傳(img-lx9PaauX-1576686013751)(https://upload-images.jianshu.io/upload_images/6004445-bfca9eef5e86975c.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)]
2. 打開命令行
可以使用快捷鍵，ctrl+r，輸入cmd進入；或者點左下角，查找或者輸入一下運行
3.正片開始
# cd表示進入這個文件夾
cd E:\workspace\gdc
# windows就是囉嗦，如果不是c盤，還要額外輸入磁盤標識
cd E
# 接着執行下載指令
gdc-client.exe download -m gdc_manifest.txt
緩慢下載中。。 估計是因爲GDC是國外服務器，距離遠，下載速度會慢很多，耐心點，掛一夜估計就好了（10分鐘可能才下3mb左右）
我是分割線：2019年12月18日01:38:02
性能優化
研究了一下下載工具，詳細看了使用文檔，寫了配置文件做了改良。
1.痛點
發現下載也會斷，而且很卡，如果掛一夜，突然在還沒入夜就斷了那其實也達不到想要目的。。可靠性太低
吐槽：很多用戶、博主只是吐槽慢，老是斷，很多時候沒有往下想，開發者是不是早就想到這些問題，已經做好了預測，做了很多騷操作，滿足大家的需要，只不過很多人都不會深入理解。
所以利用官方文檔的幫助，利用他提供的配置文件的方式進行下載配置。
2.默認配置
（可以輸入命令gdc-client.exe settings download）
[download]
no_auto_retry = False
no_file_md5sum = False
save_interval = 1073741824
retry_amount = 1
n_processes = 4
no_annotations = False
no_related_files = False
http_chunk_size = 1048576
no_segment_md5sum = False
server = https://api.gdc.cancer.gov
wait_time = 5.0
no_verify = False
dir = .
3.改良後的配方
[download]
no_auto_retry = False
no_file_md5sum = False
save_interval = 1073741824
retry_amount = 6
n_processes = 4
no_annotations = False
no_related_files = False
http_chunk_size = 4096
no_segment_md5sum = False
server = https://api.gdc.cancer.gov
wait_time = 25.0
no_verify = True
dir = .
其實很簡單，看了配置文件，用邏輯分析一下就知道怎麼配置了，主要可以配置的是http_chunk_size、wait_time、retry_amount、no_verify、n_processes
解釋一下（個人理解，可能有出入，專業的看官網）：
1. http_chunk_size：這是每一次http請求的數據塊大小，如果越大，等待時間越長，可能就會超時，就pa斷了，所以爲了保證每一次請求數據塊都能順利到達本地，就調小一點（這一步相當關鍵了）
2. wait_time：http請求的等待時間，如果超過這個等待時間，也會pa斷了，所以這一步就可以調大一丟丟
3. retry_amount：重試次數，比如說超過等待時間，就會再重新嘗試訪問，嘗試訪問次數超過，pa斷了，所以這一步也可以調大一丟丟
4. no_verify：不做校驗，（不知道它底層用什麼做校驗的），爲了求速度，不做校驗（想保證數據完整性就不要改這個啦）
5. n_processes：配置和CPU大小一致就行了
4.啓動命令
制定dtt配置文件：將改良後的配方保存到txt與exe同級目錄，命名爲gdc-client.dtt
注意：這裏dtt作爲後綴沒什麼特殊的，官網只是建議，這裏也跟着這麼定義罷了。
在控制檯輸入
gdc-client.exe download --config gdc-client.dtt -m gdc_manifest.txt
經過上面的配方，就會發現這個工具還是挺好用滴~ 而且下載後的數據更快、更穩定~
卡頓？不存在的。
next：有了這些gdc原始數據，我們還需要進行加工，轉化爲能夠方便處理數據的格式，詳見使用R語言將gdc數據轉化爲基因表達矩陣