思路是將程序做爲服務運行。
方法一：
創建服務：sc create “服務名" binpath=空格"X:\*.*(路徑)"
刪除服務：sc delete "服務名"
開啓服務：net start "服務名"
關閉服務：net stop "服務名"
如：sc create "123" binpath= "C:\1.exe" 這就創建了一個名爲"123"的服務路徑爲"C:\1.exe。開啓它則運行 net start net start "123“ 要關閉也同理。刪除則運行 sc delete “123”。
方法二：
使用Windows NT Resource Kit 提供的2個小工具：
Instrsrv.exe installs and removes system services from Windows NT.
Srvany.exe allows any Windows NT application to run as a service.
Instsrv.exe可以給系統安裝和刪除服務，Srvany.exe可以讓程序以服務的方式運行，你可以到這裏下載"Slyar_InstSrv_Srvany.rar"得到它們。下面我來說具體安裝過程。
1、將Instsrv.exe和Srvany.exe放置到某目錄下，下面用%path%代替路徑
2、打開CMD，輸入以下內容，其中ServerName爲你要創建的服務名稱
%path%\instsrv ServerName %path%\srvany.exe
3、打開regedit註冊表編輯器，找到以下目錄
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\<ServerName>
4、鼠標右鍵單擊<ServerName>，創建一個"項"，名稱爲"Parameters"
5、鼠標左鍵單擊"Parameters"，在右邊點擊鼠標右鍵，創建一個"字符串值"(REG_SZ)，名稱爲"Application"，數值數據裏填寫你要執行的程序完整路徑。
6(可選)、鼠標左鍵單擊"Parameters"，在右邊點擊鼠標右鍵，創建一個"字符串值"(REG_SZ)，名稱爲"DependOnService"，數值數據裏填寫該服務依存的服務名稱。不知道依存是什麼的，你可以保持繼續不知道，我不解釋。
7、打開services.msc服務控制面板，找到<ServerName>，鼠標右鍵-屬性-登陸，勾選"允許服務與桌面交互"(一般你要運行的程序都是有界面的吧)。
恩，一般這樣就可以了。
補充：程序可以啓動後，instsrv.exe可刪除，srvany.exe不能刪除（包括路徑都不能刪，不能動）
謝謝原作者，幫我解決了問題