免費AI標註工具-醫療影像標註工具

醫療相關的AI產品對於相關公司和醫院目前大多是冰火兩重天的場景,一面是近些年積極研發、造勢的AI相關公司的高漲熱情,一面是醫院使用率低、效果不佳的尷尬境遇,但對於醫療影像的AI相關產品的研究絕對不會止步,所以今天我們分享一個醫療影像的標註工具,給相關研究的小夥伴做一個參考。

 

本文主要從兩個方面進行說明:

    1.醫療影像數據格式

    2.醫療影像標註工具

 

一.醫療影像數據格式

DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine),文件後綴名.dcm。被廣泛應用於放射醫療領域,如:CT、DR、核磁共振、超聲等。在影像科、眼科、牙科等都有廣泛的應用。

 

DICOM標準中涵蓋了醫學數字圖像的採集、歸檔、通信、顯示及查詢等幾乎所有信息的交換協議;

 

dcm文件數據結構:

數據集(Data Set)來保存前面所介紹的信息對象定義(IOD),數據集又由多個數據元素(Data Element)組成。每個數據元素描述一條信息(所有的標準數據元素及其對應信息在標準的第六部分列出),它由對應的標記(8位16進制數,如(0008,0016),前4位是組號(Group Number),後4位是元素號(Element Number)確定 DICOM數據元素分爲兩種:

● 標準(Standard)數據元素,組號爲偶數,含義在標準中已定義。

● 私有(Private)數據元素,組號爲奇數,其描述信息的內容由用戶定義

 

CT影像樣例:

DR影像樣例:

 

瞭解DICOM文件的數據結構非常重要,我們在一般處理醫療數據的時候,必須要進行脫敏脫密,而從醫院的PACS系統導出來的時候已經包含了一些病人的隱私信息,所以技術上的脫密脫密是必須要經歷的環節。這部分內容不做本文重點就不在本文詳細介紹。

 

二.醫療影像標註工具

 此影像工具可以標註.dcm格式的片子,如:CT、DR、超聲等。

注:文件命名及文件夾名稱不能包含中文,否則打不開。

顯示界面:

工具欄:

  1. 打開數據時, 點擊左上角 File → Open Image …

  2. 選定 Dicom 數據所在的文件夾, 選擇第一張圖片

  3. 然後點open然後在Imagefileformat下面選擇DICOMImageSeries,點擊 next。

    4.加載影像後可點擊右鍵放大縮小。

    5.數據標註

    按住鼠標左鍵拖動,勾勒出病竈位置的輪廓,點擊兩次回車, 標註覆蓋整個區域。

    6.按照上述方法,逐層將數據標註完成後,保存數據結果。

       Segmentation → Save Segmentation Image …

 

以上就是影像標註工具的使用方式,醫療AI落地上遇到了很多問題,同時在醫療數據的採集和標註部分同樣的遇到了很多挑戰,例如:1.採集部分信息安全的問題,2.標註時需要專業的醫生進行標註,當然是越專業越好,例如我之前經歷的幾個項目,都必須具有5年以上的主治醫生進行標註或質檢。3.責任、政策、法律的支持等等問題。但醫療資源比較緊缺且不平衡的現實面前也是必須落地的場景,希望小夥伴們可以一起加油。

 

最後還是資源福利,獲取方式還是兩種:

    1.分享文章到朋友圈3小時以上發到公衆號後臺。

    2.公衆號--互動專區--猿小店直接獲取。

 

 

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