最近一直在分享wolai,陸續分享了我用wolai做的讀書管理、晨間日記、動漫屋、人脈管理的模板。
沒看過的可以去回顧一下~
作爲一個科研狗,這次終於輪到分享科研中的文獻管理了。
先說說我在文獻管理中遇到的問題:
我之前折騰過的文獻管理軟件有endnote,Zotero,mendeley,citavi,noteexpress。
endnote是老牌文獻管理軟件了,基本上用的人偏多,很多學校購買的也都是endnote的版權,但是endnote使用起來有諸多不便,沒有好用的文獻抓取插件,導入就很麻煩,筆記功能比較弱,有些臃腫;優點是有自帶的閱讀器,界面還好吧。
Zotero今年出了自帶閱讀器,雖然還是beta版,但是已經不錯了,在瀏覽器中搜索時,有插件可以直接抓取文獻到客戶端,輕便,反應速度快。Zotero因爲是開源軟件,所以有各路大神做了很多附加功能,可以搭建的空間比較大。
mendeley當初沒有深度使用過,不過它也有內置閱讀器,也有抓取文獻的插件(其實不太能稱之爲插件,和其它瀏覽器插件性質不太一樣)。
citavi堪稱瑞士軍刀,講真,至今都覺得citavi基本完成了文獻管理的全流程,但是也有很多槽點,響應慢,肉眼可見的慢,臃腫笨重,本來是想好好搗鼓一下citavi,作爲長期使用的一款文獻管理軟件,結果後來莫名其妙出了一個bug,我沒解決掉,加上一直使用endnote比較多,後來乾脆卸載了citavi。。。
noteexpress因爲是國產文獻管理軟件,對中文文獻比較友好,優點是可以顯示影響因子,這個功能是其他軟件沒有的。不過我實在是個顏狗,endnote和noteexpress對比,我還是喜歡endnote的界面,所以最終也沒有深度使用noteexpress。
因爲有些我沒有深度使用,所以以上各個軟件優缺點僅供參考。
總結一下,以上軟件的筆記功能都很弱,沒辦法在軟件內隨意進行引用和雙鏈。
所以,考慮利用wolai的雙向鏈接+數據表格搭建一個文獻管理。
需要說明一下,因爲wolai是知識管理軟件,並沒有文獻抓取和管理功能,所以需要和其他軟件搭配使用,這裏介紹的是wolai和Zotero的搭配使用,因爲Zotero抓取確實很爽!加上今年出的閱讀器,目前算是比較喜歡的一款了。
先來分享一下我的文獻管理模板。
依舊採用了數據表格形式,字段包含year,author,title,journal,IF(影響因子),state(閱讀狀態),note(備註),link,corresponding author,field(相當於領域或者關鍵詞),rating,doi,type(document/review)
如果文獻管理軟件裏的文獻量不是超級大的話,基本上用year+author就能快速定位到文獻,我每次在軟件裏找文獻也是利用這兩個字段。
所以和文獻管理軟件中一樣,我把year和author放在了開頭,title是第三列。
用模板中的文獻舉例:
2021年sadler發表的Transient receptor potential canonical 5 mediates inflammatory mechanical and spontaneous pain in mice
journal:science translantional medicine
IF:17.956 所以我直接設置了15-20的區間
state:表示閱讀狀態,done讀完,reading在讀,to read待讀
corresponding author:一般文獻都比較注重通訊作者是誰,所以加了這個字段
field:所屬領域或者關鍵詞,比如這篇文獻屬於pain
rating:這個是自己對於這篇文獻重要程度的評價,一星到五星
type:分document和review。我基本只讀這兩類文獻,所以只區分了這個,如果是讀RCT和Meta-Analysis之類的比較多,可以直接採用pubmed裏的分類:
我目前想到的是這些,可以根據自己的習慣增刪或者拖動調整位置,比如:如果比較關注通訊作者,就把corresponding author往左邊再拖一拖
點擊title後,可以看到該篇文獻的筆記。
思考裏面包含了三個問題:
主要講了什麼?對我有什麼用?創新之處?
這個僅供參考,可以自己修改。
further reading:輻射閱讀/延伸閱讀,就是看完這篇文獻,需要看哪些相關文獻,可以列到這裏,或者和已有筆記進行雙鏈
其餘就是文獻的部分了,順序分別是abstract,introduction,results,discussion,methods,academic phrasebank,references
因爲我讀文獻基本是這個順序,先大概看摘要和introduction,然後就是results,其實比較關注的就是這些,其餘都是補充信息了。
academic phrasebank是語料庫,可以積累該篇文獻的金句/範句。
考慮到results可能有小標題,所以以上幾個我都全部採用了大標題,嫌字號太大的可以改成中標題。
以上就是我的文獻管理模板了,一篇筆記做完之後,可以複製鏈接,在Zotero中選中該篇文獻,點擊右鍵,添加附件,附加url的鏈接,然後就把wolai 的文獻筆記和Zotero裏的文獻進行了關聯。
點擊Zotero裏的筆記鏈接,會在瀏覽器中打開wolai的筆記,如果習慣使用的是wolai網頁版,那麼這個關聯也相當不錯了。(不過我習慣用wolai客戶端,哈哈哈)
因爲數據表格也剛出一個月,各項模板都還在優化中,所以我目前文獻管理還沒有用wolai做,不過之前寫關於睡眠的文章時,都是在wolai裏整理的。
wolai沒有類似於Wikipedia的尾註功能,如果有的話,簡直都可以直接在wolai裏寫論文了。
wolai+Zotero搭建文獻管理的好處:
有雙鏈,從上面那個截圖可以看出,一旦積累出多篇文獻筆記,好處就會顯現出來,這使得同主題多篇文獻的關聯相當方便,比如我可以很方便的看出哪些筆記裏包含了“社交時差”;同時,還可以在wolai中搭建科研管理系統,如果文獻管理也在wolai中做,那麼就可以和實驗的筆記結合起來,這是比較爽的!
有數據表格,對於文獻狀態,評價等管理起來都比較方便,可以建立起讀文獻的工作流
缺點:以上這套文獻管理採用了兩款軟件,還是比較割裂,很多筆記需要旁邊有圖,有可能筆記工作量會比較大。
各有優缺點,不可能有完美的軟件,所以還是需要根據需求搭建出適合自己的,以上僅供參考啦。
wolai模板中心裏也有兩個文獻筆記模板,可以參考一下~
點擊下方鏈接,可以直接把我的文獻管理模板複製到自己的wolai裏,喜歡的可以拿去試試~
https://www.wolai.com/kGZ7JoEjfU9sS8yJwyhG1J
真的好希望有一款雙向鏈接+數據表格的文獻管理軟件橫空出世!
哎,我也就只能做夢想想。。。
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