PCA（Principal Component Analysis）是一種常用的數據分析方法。PCA通過線性變換將原始數據變換爲一組各維度線性無關的表示，可用於提取數據的主要特徵分量，常用於高維數據的降維。網上關於PCA的文章有很多，但是大多數只描述了PCA的分析過程，而沒有講述其中的原理。這篇文章的目的是介紹PCA的基本數學原理，幫助讀者瞭解PCA的工作機制是什麼。
當然我並不打算把文章寫成純數學文章，而是希望用直觀和易懂的方式敘述PCA的數學原理，所以整個文章不會引入嚴格的數學推導。希望讀者在看完這篇文章後能更好的明白PCA的工作原理。
數據的向量表示及降維問題
一般情況下，在數據挖掘和機器學習中，數據被表示爲向量。例如某個淘寶店2012年全年的流量及交易情況可以看成一組記錄的集合，其中每一天的數據是一條記錄，格式如下：
(日期, 瀏覽量, 訪客數, 下單數, 成交數, 成交金額)
其中“日期”是一個記錄標誌而非度量值，而數據挖掘關心的大多是度量值，因此如果我們忽略日期這個字段後，我們得到一組記錄，每條記錄可以被表示爲一個五維向量，其中一條看起來大約是這個樣子：
注意這裏我用了轉置，因爲習慣上使用列向量表示一條記錄（後面會看到原因），本文後面也會遵循這個準則。不過爲了方便有時我會省略轉置符號，但我們說到向量默認都是指列向量。
我們當然可以對這一組五維向量進行分析和挖掘，不過我們知道，很多機器學習算法的複雜度和數據的維數有着密切關係，甚至與維數呈指數級關聯。當然，這裏區區五維的數據，也許還無所謂，但是實際機器學習中處理成千上萬甚至幾十萬維的情況也並不罕見，在這種情況下，機器學習的資源消耗是不可接受的，因此我們必須對數據進行降維。
降維當然意味着信息的丟失，不過鑑於實際數據本身常常存在的相關性，我們可以想辦法在降維的同時將信息的損失儘量降低。
舉個例子，假如某學籍數據有兩列M和F，其中M列的取值是如何此學生爲男性取值1，爲女性取值0；而F列是學生爲女性取值1，男性取值0。此時如果我們統計全部學籍數據，會發現對於任何一條記錄來說，當M爲1時F必定爲0，反之當M爲0時F必定爲1。在這種情況下，我們將M或F去掉實際上沒有任何信息的損失，因爲只要保留一列就可以完全還原另一列。
當然上面是一個極端的情況，在現實中也許不會出現，不過類似的情況還是很常見的。例如上面淘寶店鋪的數據，從經驗我們可以知道，“瀏覽量”和“訪客數”往往具有較強的相關關係，而“下單數”和“成交數”也具有較強的相關關係。這裏我們非正式的使用“相關關係”這個詞，可以直觀理解爲“當某一天這個店鋪的瀏覽量較高（或較低）時，我們應該很大程度上認爲這天的訪客數也較高（或較低）”。後面的章節中我們會給出相關性的嚴格數學定義。
這種情況表明，如果我們刪除瀏覽量或訪客數其中一個指標，我們應該期待並不會丟失太多信息。因此我們可以刪除一個，以降低機器學習算法的複雜度。
上面給出的是降維的樸素思想描述，可以有助於直觀理解降維的動機和可行性，但並不具有操作指導意義。例如，我們到底刪除哪一列損失的信息才最小？亦或根本不是單純刪除幾列，而是通過某些變換將原始數據變爲更少的列但又使得丟失的信息最小？到底如何度量丟失信息的多少？如何根據原始數據決定具體的降維操作步驟？
要回答上面的問題，就要對降維問題進行數學化和形式化的討論。而PCA是一種具有嚴格數學基礎並且已被廣泛採用的降維方法。下面我不會直接描述PCA，而是通過逐步分析問題，讓我們一起重新“發明”一遍PCA。
向量的表示及基變換
既然我們面對的數據被抽象爲一組向量，那麼下面有必要研究一些向量的數學性質。而這些數學性質將成爲後續導出PCA的理論基礎。
內積與投影
下面先來看一個高中就學過的向量運算：內積。兩個維數相同的向量的內積被定義爲：
內積運算將兩個向量映射爲一個實數。其計算方式非常容易理解，但是其意義並不明顯。下面我們分析內積的幾何意義。假設A和B是兩個n維向量，我們知道n維向量可以等價表示爲n維空間中的一條從原點發射的有向線段，爲了簡單起見我們假設A和B均爲二維向量，則
好，現在我們從A點向B所在直線引一條垂線。我們知道垂線與B的交點叫做A在B上的投影，再設A與B的夾角是a，則投影的矢量長度爲
注意這裏我們專門區分了矢量長度和標量長度，標量長度總是大於等於0，值就是線段的長度；而矢量長度可能爲負，其絕對值是線段長度，而符號取決於其方向與標準方向相同或相反。
到這裏還是看不出內積和這東西有什麼關係，不過如果我們將內積表示爲另一種我們熟悉的形式：
現在事情似乎是有點眉目了：A與B的內積等於A到B的投影長度乘以B的模。再進一步，如果我們假設B的模爲1，即讓
也就是說，設向量B的模爲1，則A與B的內積值等於A向B所在直線投影的矢量長度！這就是內積的一種幾何解釋，也是我們得到的第一個重要結論。在後面的推導中，將反覆使用這個結論。
基
下面我們繼續在二維空間內討論向量。上文說過，一個二維向量可以對應二維笛卡爾直角座標系中從原點出發的一個有向線段。例如下面這個向量：
在代數表示方面，我們經常用線段終點的點座標表示向量，例如上面的向量可以表示爲(3,2)，這是我們再熟悉不過的向量表示。
不過我們常常忽略，只有一個(3,2)本身是不能夠精確表示一個向量的。我們仔細看一下，這裏的3實際表示的是向量在x軸上的投影值是3，在y軸上的投影值是2。也就是說我們其實隱式引入了一個定義：以x軸和y軸上正方向長度爲1的向量爲標準。那麼一個向量(3,2)實際是說在x軸投影爲3而y軸的投影爲2。注意投影是一個矢量，所以可以爲負。
更正式的說，向量(x,y)實際上表示線性組合：
不難證明所有二維向量都可以表示爲這樣的線性組合。此處(1,0)和(0,1)叫做二維空間中的一組基。
所以，要準確描述向量，首先要確定一組基，然後給出在基所在的各個直線上的投影值，就可以了。只不過我們經常省略第一步，而默認以(1,0)和(0,1)爲基。
我們之所以默認選擇(1,0)和(0,1)爲基，當然是比較方便，因爲它們分別是x和y軸正方向上的單位向量，因此就使得二維平面上點座標和向量一一對應，非常方便。但實際上任何兩個線性無關的二維向量都可以成爲一組基，所謂線性無關在二維平面內可以直觀認爲是兩個不在一條直線上的向量。
例如，(1,1)和(-1,1)也可以成爲一組基。一般來說，我們希望基的模是1，因爲從內積的意義可以看到，如果基的模是1，那麼就可以方便的用向量點乘基而直接獲得其在新基上的座標了！實際上，對應任何一個向量我們總可以找到其同方向上模爲1的向量，只要讓兩個分量分別除以模就好了。例如，上面的基可以變爲
現在，我們想獲得(3,2)在新基上的座標，即在兩個方向上的投影矢量值，那麼根據內積的幾何意義，我們只要分別計算(3,2)和兩個基的內積，不難得到新的座標爲
另外這裏要注意的是，我們列舉的例子中基是正交的（即內積爲0，或直觀說相互垂直），但可以成爲一組基的唯一要求就是線性無關，非正交的基也是可以的。不過因爲正交基有較好的性質，所以一般使用的基都是正交的。
基變換的矩陣表示
下面我們找一種簡便的方式來表示基變換。還是拿上面的例子，想一下，將(3,2)變換爲新基上的座標，就是用(3,2)與第一個基做內積運算，作爲第一個新的座標分量，然後用(3,2)與第二個基做內積運算，作爲第二個新座標的分量。實際上，我們可以用矩陣相乘的形式簡潔的表示這個變換：
太漂亮了！其中矩陣的兩行分別爲兩個基，乘以原向量，其結果剛好爲新基的座標。可以稍微推廣一下，如果我們有m個二維向量，只要將二維向量按列排成一個兩行m列矩陣，然後用“基矩陣”乘以這個矩陣，就得到了所有這些向量在新基下的值。例如(1,1)，(2,2)，(3,3)，想變換到剛纔那組基上，則可以這樣表示：
於是一組向量的基變換被幹淨的表示爲矩陣的相乘。
一般的，如果我們有M個N維向量，想將其變換爲由R個N維向量表示的新空間中，那麼首先將R個基按行組成矩陣A，然後將向量按列組成矩陣B，那麼兩矩陣的乘積AB就是變換結果，其中AB的第m列爲A中第m列變換後的結果。
數學表示爲：
其中
特別要注意的是，這裏R可以小於N，而R決定了變換後數據的維數。也就是說，我們可以將一N維數據變換到更低維度的空間中去，變換後的維度取決於基的數量。因此這種矩陣相乘的表示也可以表示降維變換。
最後，上述分析同時給矩陣相乘找到了一種物理解釋：兩個矩陣相乘的意義是將右邊矩陣中的每一列列向量變換到左邊矩陣中每一行行向量爲基所表示的空間中去。更抽象的說，一個矩陣可以表示一種線性變換。很多同學在學線性代數時對矩陣相乘的方法感到奇怪，但是如果明白了矩陣相乘的物理意義，其合理性就一目瞭然了。
協方差矩陣及優化目標
上面我們討論了選擇不同的基可以對同樣一組數據給出不同的表示，而且如果基的數量少於向量本身的維數，則可以達到降維的效果。但是我們還沒有回答一個最最關鍵的問題：如何選擇基纔是最優的。或者說，如果我們有一組N維向量，現在要將其降到K維（K小於N），那麼我們應該如何選擇K個基才能最大程度保留原有的信息？
要完全數學化這個問題非常繁雜，這裏我們用一種非形式化的直觀方法來看這個問題。
爲了避免過於抽象的討論，我們仍以一個具體的例子展開。假設我們的數據由五條記錄組成，將它們表示成矩陣形式：
其中每一列爲一條數據記錄，而一行爲一個字段。爲了後續處理方便，我們首先將每個字段內所有值都減去字段均值，其結果是將每個字段都變爲均值爲0（這樣做的道理和好處後面會看到）。
我們看上面的數據，第一個字段均值爲2，第二個字段均值爲3，所以變換後：
我們可以看下五條數據在平面直角座標系內的樣子：
現在問題來了：如果我們必須使用一維來表示這些數據，又希望儘量保留原始的信息，你要如何選擇？
通過上一節對基變換的討論我們知道，這個問題實際上是要在二維平面中選擇一個方向，將所有數據都投影到這個方向所在直線上，用投影值表示原始記錄。這是一個實際的二維降到一維的問題。
那麼如何選擇這個方向（或者說基）才能儘量保留最多的原始信息呢？一種直觀的看法是：希望投影后的投影值儘可能分散。
以上圖爲例，可以看出如果向x軸投影，那麼最左邊的兩個點會重疊在一起，中間的兩個點也會重疊在一起，於是本身四個各不相同的二維點投影后只剩下兩個不同的值了，這是一種嚴重的信息丟失，同理，如果向y軸投影最上面的兩個點和分佈在x軸上的兩個點也會重疊。所以看來x和y軸都不是最好的投影選擇。我們直觀目測，如果向通過第一象限和第三象限的斜線投影，則五個點在投影后還是可以區分的。
下面，我們用數學方法表述這個問題。
方差
上文說到，我們希望投影后投影值儘可能分散，而這種分散程度，可以用數學上的方差來表述。此處，一個字段的方差可以看做是每個元素與字段均值的差的平方和的均值，即：
由於上面我們已經將每個字段的均值都化爲0了，因此方差可以直接用每個元素的平方和除以元素個數表示：
於是上面的問題被形式化表述爲：尋找一個一維基，使得所有數據變換爲這個基上的座標表示後，方差值最大。
協方差
對於上面二維降成一維的問題來說，找到那個使得方差最大的方向就可以了。不過對於更高維，還有一個問題需要解決。考慮三維降到二維問題。與之前相同，首先我們希望找到一個方向使得投影后方差最大，這樣就完成了第一個方向的選擇，繼而我們選擇第二個投影方向。
如果我們還是單純只選擇方差最大的方向，很明顯，這個方向與第一個方向應該是“幾乎重合在一起”，顯然這樣的維度是沒有用的，因此，應該有其他約束條件。從直觀上說，讓兩個字段儘可能表示更多的原始信息，我們是不希望它們之間存在（線性）相關性的，因爲相關性意味着兩個字段不是完全獨立，必然存在重複表示的信息。
數學上可以用兩個字段的協方差表示其相關性，由於已經讓每個字段均值爲0，則：
可以看到，在字段均值爲0的情況下，兩個字段的協方差簡潔的表示爲其內積除以元素數m。
當協方差爲0時，表示兩個字段完全獨立。爲了讓協方差爲0，我們選擇第二個基時只能在與第一個基正交的方向上選擇。因此最終選擇的兩個方向一定是正交的。
至此，我們得到了降維問題的優化目標：將一組N維向量降爲K維（K大於0，小於N），其目標是選擇K個單位（模爲1）正交基，使得原始數據變換到這組基上後，各字段兩兩間協方差爲0，而字段的方差則儘可能大（在正交的約束下，取最大的K個方差）。
協方差矩陣
上面我們導出了優化目標，但是這個目標似乎不能直接作爲操作指南（或者說算法），因爲它只說要什麼，但根本沒有說怎麼做。所以我們要繼續在數學上研究計算方案。
我們看到，最終要達到的目的與字段內方差及字段間協方差有密切關係。因此我們希望能將兩者統一表示，仔細觀察發現，兩者均可以表示爲內積的形式，而內積又與矩陣相乘密切相關。於是我們來了靈感：
假設我們只有a和b兩個字段，那麼我們將它們按行組成矩陣X：
然後我們用X乘以X的轉置，並乘上係數1/m：
奇蹟出現了！這個矩陣對角線上的兩個元素分別是兩個字段的方差，而其它元素是a和b的協方差。兩者被統一到了一個矩陣的。
根據矩陣相乘的運算法則，這個結論很容易被推廣到一般情況：
設我們有m個n維數據記錄，將其按列排成n乘m的矩陣X，設
協方差矩陣對角化
根據上述推導，我們發現要達到優化目前，等價於將協方差矩陣對角化：即除對角線外的其它元素化爲0，並且在對角線上將元素按大小從上到下排列，這樣我們就達到了優化目的。這樣說可能還不是很明晰，我們進一步看下原矩陣與基變換後矩陣協方差矩陣的關係：
設原始數據矩陣X對應的協方差矩陣爲C，而P是一組基按行組成的矩陣，設Y=PX，則Y爲X對P做基變換後的數據。設Y的協方差矩陣爲D，我們推導一下D與C的關係：
現在事情很明白了！我們要找的P不是別的，而是能讓原始協方差矩陣對角化的P。換句話說，優化目標變成了尋找一個矩陣P，滿足
至此，我們離“發明”PCA還有僅一步之遙！
現在所有焦點都聚焦在了協方差矩陣對角化問題上，有時，我們真應該感謝數學家的先行，因爲矩陣對角化在線性代數領域已經屬於被玩爛了的東西，所以這在數學上根本不是問題。
由上文知道，協方差矩陣C是一個是對稱矩陣，在線性代數上，實對稱矩陣有一系列非常好的性質：
1）實對稱矩陣不同特徵值對應的特徵向量必然正交。
2）設特徵向量
由上面兩條可知，一個n行n列的實對稱矩陣一定可以找到n個單位正交特徵向量，設這n個特徵向量爲
則對協方差矩陣C有如下結論：
其中
以上結論不再給出嚴格的數學證明，對證明感興趣的朋友可以參考線性代數書籍關於“實對稱矩陣對角化”的內容。
到這裏，我們發現我們已經找到了需要的矩陣P：
P是協方差矩陣的特徵向量單位化後按行排列出的矩陣，其中每一行都是C的一個特徵向量。如果設P按照
至此我們完成了整個PCA的數學原理討論。在下面的一節，我們將給出PCA的一個實例。
算法及實例
爲了鞏固上面的理論，我們在這一節給出一個具體的PCA實例。
PCA算法
總結一下PCA的算法步驟：
設有m條n維數據。
1）將原始數據按列組成n行m列矩陣X
2）將X的每一行（代表一個屬性字段）進行零均值化，即減去這一行的均值
3）求出協方差矩陣
4）求出協方差矩陣的特徵值及對應的特徵向量
5）將特徵向量按對應特徵值大小從上到下按行排列成矩陣，取前k行組成矩陣P
6）
實例
這裏以上文提到的
爲例，我們用PCA方法將這組二維數據其降到一維。
因爲這個矩陣的每行已經是零均值，這裏我們直接求協方差矩陣：
然後求其特徵值和特徵向量，具體求解方法不再詳述，可以參考相關資料。求解後特徵值爲：
其對應的特徵向量分別是：
其中對應的特徵向量分別是一個通解，
因此我們的矩陣P是：
可以驗證協方差矩陣C的對角化：
最後我們用P的第一行乘以數據矩陣，就得到了降維後的表示：
降維投影結果如下圖：
進一步討論
根據上面對PCA的數學原理的解釋，我們可以瞭解到一些PCA的能力和限制。PCA本質上是將方差最大的方向作爲主要特徵，並且在各個正交方向上將數據“離相關”，也就是讓它們在不同正交方向上沒有相關性。
因此，PCA也存在一些限制，例如它可以很好的解除線性相關，但是對於高階相關性就沒有辦法了，對於存在高階相關性的數據，可以考慮Kernel PCA，通過Kernel函數將非線性相關轉爲線性相關，關於這點就不展開討論了。另外，PCA假設數據各主特徵是分佈在正交方向上，如果在非正交方向上存在幾個方差較大的方向，PCA的效果就大打折扣了。
最後需要說明的是，PCA是一種無參數技術，也就是說面對同樣的數據，如果不考慮清洗，誰來做結果都一樣，沒有主觀參數的介入，所以PCA便於通用實現，但是本身無法個性化的優化。
希望這篇文章能幫助朋友們瞭解PCA的數學理論基礎和實現原理，藉此瞭解PCA的適用場景和限制，從而更好的使用這個算法。
原文：http://blog.codinglabs.org/articles/pca-tutorial.html