10X_Genomics_scRNA_Seq 名詞解釋

Sample(樣本):單個生物來源(血液、組織等)提取的細胞混懸液。(標示是index)

Library(文庫):從一個樣本製備的1個10X-barcoded測序文庫,對應着一個10x Chromium Controller run 的單芯片通道。(標示是barcoded)

Flowcell:一個類似載玻片的測序芯片,包含了一個run的測序數據,該數據可根據芯片上的 lane 和 樣本的 index 拆分。

lane(通道):通常一張flowcell(芯片)上會有多條lane

一個sample可製備多個library,這樣不必重複加10x Chromium Controller run就能獲得更多細胞數

一個文庫(library)可以被多個芯片(flowcell)測序,然後合併,就像這些read是從一次run獲得的

一個芯片(flowcell)可以包含多個文庫(library),按照 lane 區分和 index 拆分

一個通道(lane)上可以包含多個文庫(library),按照文庫(library)的 barcoded 拆分

10X_Genomics 給出的工作流程示例:

 

 

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