Usage: seqtk <command><arguments>
Version:1.2-r94
Command: seq common transformation of FASTA/Q // 常用格式轉換FASTA/Q
comp get the nucleotide composition of FASTA/Q // 獲得FASTA/Q的核苷酸組成
sample subsample sequences // 子樣本序列
subseq extract subsequences from FASTA/Q // 從FASTA/Q中提取子序列
fqchk fastq QC (base/quality summary)// FASQ QC(基本/質量摘要)
mergepe interleave two PE FASTA/Q files //疊合兩個 PE FASTA/Q 文件
trimfq trim FASTQ using the Phred algorithm //使用Phred 算法修剪 FASTQ 文件
hety regional heterozygosity // 區域雜合性
gc identify high-or low-GC regions // 識別高的或者低的GC區域
mutfa point mutate FASTA at specified positions // 在指定位置突變 FASTA 文件
mergefa merge two FASTA/Q files // 融合兩個FASTA/Q 文件
famask apply a X-coded FASTA to a source FASTA //將X-coded FASTA 應用到源FASTA上
dropse drop unpaired from interleaved PE FASTA/Q //從疊合的PE FASA/Q中刪除未成對
rename rename sequence names // 重命名序列名稱
randbase choose a random base from hets // 從HETS中隨機選擇鹼基
cutN cut sequence at long N //切割序列
listhet extract the position of each het //抓取每一個het的位子