Linux是以“一切皆是文件”這一思想構建起來的操作系統，因此有必要熟悉其各目錄的用途。Linux中目錄結構仍然是樹形結構，目錄樹的根節點稱爲根目錄，用“/”表示。對你的電腦來說，有且只有一個根目錄。所有的東西都是從這裏開始。
/bin：該目錄存放二進制可執行命令，bin是binary的簡稱，包含了引導啓動所需的命令或普通用戶可能用的命令。這些命令都是二進制文件的可執行程序，多是系統中重要的系統文件。
/boot：該目錄存放引導加載器(bootloader)使用的文件，內核文件也經常放在這裏，而不是放在根目錄中。
/dev：該目錄包括所有設備的設備文件，用戶通過這些文件訪問外部設備。設備文件用特定的約定命名，這在設備列表中有說明。設備文件在安裝時由系統產生，以後可以用/dev/makedev描述。
1．/dev/console系統控制檯，也就是直接和系統連接的監視器（電腦屏幕）。
2．/dev/hd：IDE硬盤。如/dev/hda指的是第一個硬盤，hda1則是指/dev/hda的第一個分區。
3．/dev/sd：SATA、SCSI硬盤，命名方法同IDE硬盤。
4．/dev/fd：軟驅設備。已淘汰。
5．/dev/st：SCSI磁帶驅動器驅動程序。很少見。
6．/dev/tty：提供虛擬控制檯支持。如/dev/tty1指的是系統的第一個虛擬控制檯。
7．/dev/pty：提供遠程登陸僞終端支持。在進行telnet登錄時就要用到/dev/pty設備。
8．/dev/ttys：計算機串行接口，即Windows中常見的COM1、COM2。
10．/dev/null：空設備，也稱爲“黑洞”，所有寫入該設備的信息都將消失。
/etc：英文單詞etc是“等等”的意思，該目錄存放着各種系統配置文件等一些雜項文件，其中包括了用戶信息文件/etc/passwd，系統初始化文件/etc/rc等。
1．/etc/rc或/etc/rc.d或/etc/rc?.d：啓動、或改變運行級時運行的腳本或腳本的目錄。
2．/etc/passwd：用戶數據，其中的域給出了用戶名、真實姓名、用戶起始目錄、加密口令等信息。
3．/etc/fstab：指定啓動時需要自動安裝的文件系統列表，也包括swap區的信息。
4．/etc/group：說明的是組的信息，包括組的各種數據，類似/etc/passwd。
5．/etc/inittab：init的配置文件。
6．/etc/issue：包括用戶在登錄提示符前的輸出信息。通常包括系統的一段說明或歡迎信息。
7．/etc/magic：“file”的配置文件。包含不同文件格式的說明，“file”基於它猜測文件類型。
8．/etc/motd：motd是message ofthe day的縮寫，用戶成功登錄後自動輸出。內容由系統管理員確定。常用於通告信息，如計劃關機時間的警告等
9．/etc/mtab：當前安裝的文件系統列表，當需要一個當前安裝的文件系統的列表時使用。
10．/etc/shadow：該文件保存/etc/passwd文件中的加密口令，且只對超級用戶(root)可讀。
11．/etc/login.defs：login命令的配置文件。
15．/etc/profile、/etc/csh.login、/etc/csh.cshrc：登錄或啓動時shell執行的文件，建立全局缺省環境。
16．/etc/securetty：確認安全終端，即哪個終端允許root登錄。
17．/etc/shells：列出可以使用的shell。
/home：該目錄是用戶主目錄的基點，例如名稱爲user的用戶主目錄就是/home/user，可以用~/user表示。
/lib：標準程序設計庫，即動態鏈接共享庫。該目錄是根文件系統上的程序所需的共享庫，存放了根文件系統程序運行所需的共享文件。類似於Windows中的dll文件。
/lib/modules：目錄包含系統核心，可加載各種模塊，尤其是那些在恢復損壞的系統時重新引導系統所需的模塊。
/lost+found：該目錄平時是空的，存儲系統非正常關機而留下臨時文件，可用於文件恢復。
/media：有些linux的發行版使用這個目錄來掛載那些USB接口的移動硬盤、CD/DVD驅動器等等。
/mnt：該目錄是讓用戶臨時掛載其他的文件系統。一般爲空，可在其中新建目錄掛載其他設備。
/opt：該目錄主要存放那些可選的程序。可將試用程序放於該文件夾下試用，刪除該文件夾中的應用程序不會造成系統問題。
/proc：proc是一種虛擬文件系統。該目錄是系統內存的映射，可直接訪問這個目錄來獲取系統信息，這些信息是在內存中由系統自己產生的，該目錄的內容不在硬盤上而在內存裏。
/root：root的主目錄，僅root用戶可見。
/sbin：該目錄存放的是系統管理員使用的管理程序。類似於/bin，也用於存儲二進制文件。其中的大部分文件多是系統管理員使用的基本的系統程序，普通用戶想要使用時，也要得到允許纔行，但一般不給普通用戶使用。
/sys：sysfs 文件系統掛載點。雖然在較早期的2.6內核系統上並沒有規定 sysfs 的標準掛載位置，可以把 sysfs 掛載在任何位置，但較近的2.6內核修正了這一規則，要求 sysfs 總是掛載在 /sys 目錄上。
/tmp：該目錄存放程序在運行時產生的信息和數據。
/usr：該存放應用程序和文件，其中的文件一般來自linux發行版。本地安裝的程序和其他東西在/usr/local下，這樣可以在升級新版系統或新發行版時無須重新安裝全部程序。
1．/usr/x11r6：包含x window系統的所有可執行程序、配置文件和支持文件。
2．/usr/bin：集中了幾乎所有用戶命令，是系統的軟件庫。另有些命令在/bin或/usr/local/bin中。
3．/usr/sbin：包括了普通用戶可以使用的系統管理命令。
4．/usr/man、/usr/info、/usr/doc：這些目錄包含所有手冊頁、gnu信息文檔和各種其他文檔文件。
5．/usr/include：包含了C語言的頭文件，這些文件多以.h結尾，用來描述C語言程序中用到的數據結構、子過程和常量。爲了保持一致性，這實際上應該放在/usr/lib下，但習慣上一直沿用了這個名字。
6．/usr/lib：包含了程序或子系統的不變的數據文件，包括一些site-wide配置文件。名字lib來源於庫(library)；編程的原始庫也存在/usr/lib 裏。當編譯程序時，程序便會和其中的庫進行連接。也有許多程序把配置文件存入其中
7．/usr/local：存放本地安裝的軟件和其他文件。
/var：該目錄包含系統一般運行時要改變的數據。通常這些數據所在的目錄的大小是要經常變化或擴充的。
1．/var/catman
包括了格式化過的幫助( man )頁。幫助頁的源文件一般存在/usr/man/man中；有些man頁可能有預格式化的版本，存在/usr/man/cat中。而其他的man頁在第一次看時都需要格式化，格式化完的版本存在/var/man 中，這樣其他人再看相同的頁時就無須再格式化了。 /var/catman 經常被清除，就像清除臨時目錄一樣。
2．/var/lib：存放系統正常運行時要改變的文件。
3．/var/local：存放/usr/local中安裝的程序的可變數據。
4．/var/lock：鎖定文件。許多程序遵循在/var/lock中產生一個鎖定文件的約定，以用來支持他們正在使用某個特定的設備或文件。其他程序注意到這個鎖定文件時，就不會再使用這個設備或文件。
5．/var/log：各種程序的日誌文件，尤其是login和syslog。
6．/var/run：保存在下一次系統引導前有效的關於系統的信息文件。