| 軟件名稱 | 類型 | 描述 | 官網或下載鏈接 |
| 3D Slicer | 通用 | 3D Slicer是一款開源免費的軟件，用於圖像處理和分析，支持三維處理切片等功能，可在多個平臺使用，支持Windows, Linux以及Mac OS X。 | |
| MIMICS | 通用 |
MIMICS是一款工具化的圖像處理平臺，功能豐富自主性強，系統採用模塊化結構的軟件，是一套高度整合而且易用的3D圖像生成及編輯處理軟件。 基礎模塊包括:圖像導入、圖像分割、可視化、圖像配準、圖像測量、快速成型切片等。 |
https://blog.csdn.net/weixin_42052612/article/details/83786706 |
| ImageJ | 通用 | 美國國家衛生研究院發起的一個跨平臺、高效、穩定可運行的Java圖像處理工具，開放源代碼與插件機制。提供圖像形態學處理、去噪、尺度變換、像素統計測量、格式轉換等功能。 | |
| VTK | 通用 | VTK是一個開源的免費軟件系統，主要用於三維計算機圖形學、圖像處理和可視化。全世界的數以千計的研究人員和開發人員用它來進行3D計算機圖形，圖像處理，可視化。 | |
| SPM12 | 功能磁共振成像，PET， SPECT，EEG 和 MEG。 |
統計參數映射是指用於測試有關功能成像數據的假設的空間擴展統計過程的構建和評估。這些想法已在名爲SPM的軟件中實例化。 SPM軟件包已被設計用於腦成像的數據序列的分析。序列可以是來自不同隊列的一系列圖像，也可以是來自同一受試者的時間序列。當前版本旨在分析 功能磁共振成像，PET， SPECT，EEG 和 MEG。 |
https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ |