天子呼來不上船，
自稱臣是菜鳥團。
在這裏，和國際同行一起學習單細胞數據分析。
Seurat V4 的教程頁面做了全面的改進，用pkgdown構建了新的教程體系：
可以說是從其開發團隊獨立出來了，但是他們依然十分熱心地在Github上耐心地回覆着來自全球用戶的問題，儘管很多問題都可以通過檢索得到答案。GitHub上的Issues列表已經4k多了。還是建議大家在學習的時候，直接打開官網教程，不要copy不知道哪來的教程，一個是版本更新，一個是寫教程的人水平有限。新的教程更加詳細，也打開了單細胞新的應用場景：
這些分析點交給公司做，不知道他們要收你幾何錢，關鍵還很慢。所以，代碼在這了，何不學起來？卿言多務，孰若孤？如何系統學習一個R包？你是如何知道這些功能的，爲什麼我下載安裝之後，很多已經有的函數我卻不知道呢？不要以爲開始一個R包的姿勢是這樣的：
install.packages('Seurat')
library(Seurat)
成年人的學習是從讀文檔開始的。如何找到所有函數的文檔呢？要知道在R裏面想要問一個函數，首先要知道這個函數名。其實CRAN系統已經爲我們準備好了一個R包的所有函數，所有參數的文檔說明。在Seurat的CRAN的界面上可以看到有這些信息：
其中：
- 1 用戶手冊。我們Seurat Weekly 之所以能夠寫道十二期，就是因爲主理人讀過Seurat的每一個函數，每一個參數的介紹，V4的手冊一共205頁。我們可以用
pacman查看有多少個函數：
packageVersion('Seurat')
[1] ‘3.9.9.9005’
> library(pacman)
> length( p_functions("Seurat"))
[1] 274
當然並不是都是顯式的函數，200還是有的。
- 2 當前V4.0.0的源代碼。有Windows安裝用的文件和Linux的源碼。
- 3 macOS的文件。其實每一個託管在CRAN上面的R包，都會提供這個三個主流系統的源碼，保證跨平臺的R都可以安裝使用。
- 4 舊版本的源碼。有時候我們想要安裝舊版本的，卻不知道在哪下載，就這裏了：
學習新的工具，我們的建議是先用教程數據熟悉工具，再來分析自己的數據。先練武再打仗，但是切記：模仿總有邊界，學習永無止境。不要被教程限制，學完了就應該想着如何超越。尼采說：人，生來是要被超越的。
https://cloud.r-project.org/web/packages/Seurat/index.html
https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Seurat/