前兩天我們對於tRFs的功能同時也推薦了幾個關於tRFs的數據庫。其中包括tRFs在TCGA當中研究的數據庫以及tRFs靶基因預測數據庫。這些數據庫都是基於分析好的數據來的。但是如果我們有自己的數據，想要分析相關的tRFs，但又不會用代碼進行分析。怎麼辦呢？今天就給大家推薦一個在線分析tRFs的數據庫。tsRFun（[http://121.46.19.89/DB/tsRFun/]）
目前這個數據庫主要可以進行以下四種分析。通過下圖可以發現，基本上我們前面介紹的靶基因預測和在腫瘤當中的作用的分析。在這個數據庫都可以做。同時這個數據庫還可以分析自己的測序數據。可謂是一個數據庫就搞定所有的事情了。
由於tsRFun數據庫還沒有發表自己的相關文章，所以我們也就不清楚具體用了什麼數據來進行分析預測。這裏只簡單地介紹一下他的功能
tRFs鑑定
如果我們有自己的小RNA測序的數據的話，同時又想要在裏面挖掘一些新的東西。這個時候就可以考慮重新註釋一下。來尋找裏面有沒有tRFs的。這個時候就可以使用裏面的tsRFinder的功能。在tsRFinder當中我們可以輸入測序後的fasta數據，如果測序的序列比較多可以上傳壓縮包即可。
在點擊提交之後，由於要進行序列的比對，所以需要耐心的等待。等待結束後，就可以得到測序數據當中相關的tRFs都是哪些了。在這個結果當中，我們可以查看比對的tRFs的具體信息，也可以觀察目標tRFs在腫瘤當中的分佈。
進一步的，如果相對目標的tRFs進行功能預測，則可以在後面選擇上之後，直接點擊提交。即可預測目標tRFs的功能。
tRFs靶基因預測
同樣的如果有自己做的CLASH/CLIP-seq的數據，想要重新預測一下有沒有和tRFs有關的結果。也可以使用這個數據庫來進行分析。分析之前需要指定一下目標參數，然後也是直接輸入fasta的測序結果即可。
經過分析，我們可以瞭解目標tRFs和哪些基因有相互作用關係。同時具體的作用方式在哪裏
tRFs在腫瘤當中的分析
除了以上上傳上傳自己的數據可以進行分析之外，我們也可以上查看在TCGA數據庫當中具體的tRFs的發表情況。在這個數據庫當中只能看到tRFs的在不同腫瘤的表達情況。但是如果要看預後的話，就不行了。這個時候就看可以使用OncotRF這個數據庫了。
tRFs功能預測
這個部分的內容，就和前兩天介紹的tRFTar差不多了。我們可以選擇目標tRF或者輸入tRFs的序列就可以基於數據庫分析好的數據集來進行富集分析了。
和tRFTar不同的時候，tRFun預測的背景數據庫多了一些。同時在功能預測的時候，也可以使用GSEA進行預測。
總的來說
以上就是這個數據庫的主要功能了。單論功能的話，基本上可以把之前介紹的兩個數據庫都包括了。有一些特定的比如查看預後這樣的功能還是需要用指定數據庫的。另外目前這個數據庫還沒有發表。至於這個數據庫的最終版是什麼樣子的。這個誰也不清楚。說不準還會多更多的功能的。