對於某一類領域的研究而言，總有一些經典的數據庫是在開始研究這個領域之前就需要知道的一些數據庫。如果要研究醫學方面的科研，那肯定是要了解pubmed的吧。那麼，如果要研究circRNA的話，那對於circBase(http://www.circbase.org/)這個數據庫就需要了解一下。
從數據庫文章的被引次數上也可以看到。這個數據庫在所有的circRNA數據庫當中也是經典的數據庫。
starBase由於非編碼RNA方面的綜合性的數據庫。用處比較廣。所以用的人更多。如果是專業性circRNA數據庫的話，那就是circBase了。如果想要了解starBase的話，可以看我們這個文章：Here is yuque doc card, click on the link to view:https://www.yuque.com/go/doc/13944418
鑑於這麼重要性的一個數據庫，所以我們今天就來介紹一下這個數據庫吧。
背景數據集
對於circRNA的鑑定，作者主要是通過通過收集之前發表的文章的數據來總結相關的circRNA的類型的。在目前這個circBase的版本當中，作者收集了來自9個機構關於circRNA鑑定的結果。其中包括了人類、老鼠等多個物種。
由於circRNA最基本的都是基於其位置來進行表示的。作者在收集了這麼多的circRNA的數據之後，對這些檢測到的circRNA進行了circRNA的命名。因此也就看到了目前在研究的circRNA當中關於circRNA的命名好多都是來自於circBase數據庫。
數據庫使用
在瞭解了數據庫的內置數據集之後，對於數據庫的使用就比較簡單了。在這個數據庫當中，一共具有三個功能。
檢索目標基因的circRNA
由於circRNA主要也是在基因組上形成了。很多circRNA也是和基因是重疊的。如果我們想要知道某一個基因是否有circRN形成。就可以通過這個功能來進行檢索
例如我們想要檢索一下在TP53這個基因上是否有circRNA形成。就可以在Search list當中輸入TP53即可。經過檢索發現，一共有五個circRNA是在TP53上面形成的。
檢索所有的circRNA
如果想要查看某一個組織當中的所有circRNA。就可以使用這個功能。在這裏，我們只需要輸入基於自己的想法選擇合適的位置即可。
circRNA比對
如果有一段特定的序列，想要知道這段序列上會不會有circRNA的話。那麼就可以通過blat這個功能進行比對。我們需要做的也就是輸入自己的目標序列即可。如果有輸入的時候fa序列的話，那麼也就可以輸入多條序列
總的來說
以上就是這個數據庫的基本內容了。總的來說就是需要什麼就檢索什麼即可，除了在線的功能，我們還可以下載這個數據庫當中的所有數據。
通過下載就可以獲得這個數據庫的所有數據了，如果要對circRNA方面進行分析的話，也就可以方便我們進行自己的DIY。