我們都知道，細胞標誌物是我們用來對細胞定義和分選的重要標誌。當我們想查看某細胞的標誌物時，不可能對所有細胞都進行測序分析，首先，經費就燒不起。。。。。。
所以，今天小編就給大家介紹一個特別優秀的數據庫：CellMarker（http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/index.jsp），直接通過點點點，就能查看哪些細胞的標誌物/基因是什麼，是不是瞬間感覺高大上~
該數據庫通過手動收集超過100,000篇發表的論文，涵蓋細胞標誌物信息，組織類型，細胞類型，癌症信息和來源等4,124個條目。共包含158種人類組織/亞組織（涵蓋467種細胞類型，13605個細胞標誌物）及81種小鼠組織/亞組織（涵蓋389種細胞類型，9148個細胞標誌物），旨在爲人類和小鼠組織中的各種細胞類型提供全面而準確的細胞標誌物資源。
下面我們就來簡要看一下該數據庫的使用方法。
- Home
主頁提供了人和鼠的全局視圖。該圖可以幫助我們快速瀏覽列出的細胞類型的細胞標誌物。單擊細胞類型時，它將跳到與該細胞類型相關的細胞標誌物的相應搜索結果。
- **Browse **
瀏覽頁面顯示了細胞和組織的層次分類。我們可以通過單擊人類（或小鼠）不同組織中的細胞類型來瀏覽查看細胞標誌物。
例如，我們這裏想瀏覽與人體脂肪組織相關的條目，可以單擊“Human”，選擇“Human Adipose tissue”，選擇感興趣的細胞類型，例如“Endothelial cell”。右側將顯示相關的細胞標誌物。
結果首先會顯示一張所查詢細胞的細胞標誌物的詞雲圖，該圖可以通過支持證據（即出版物）的數量和所查詢細胞類型的綜合性細胞標誌物列表進行量化。
“Result”頁面主要根據數據來源（單細胞RNA測序，實驗，綜述和公司）進行詳細展開。每個條目均包含物種，組織，細胞類型，癌症，細胞標誌物，來源等。
下面示例所展示的結果主要包含實驗和公司來源。
單擊這些表中單個條目的“more details”超鏈接，我們可以獲得更詳細的信息，包括基因名稱，基因ID，蛋白質名稱，出版物信息等。
- Search
我們可以通過兩個搜索面板進行查詢：Cell search和Marker search。
（1）Cell search
按照下圖所示，依次選擇物種，組織，細胞類型來搜索目標細胞的細胞標誌物。
結果如下：
（2）Marker search
選擇物種後，我們可以通過輸入基因名稱，基因ID或蛋白質名稱來搜索感興趣的基因，以查詢特定基因可以在哪些組織的哪些細胞類型中充當細胞標記物。
單擊“提交”按鈕後，結果顯示一個交互式氣泡圖和一個表格。交互式氣泡圖顯示了感興趣的基因在不同組織的不同細胞中用作細胞標記的頻率。
- Download
CellMarker數據庫提供TXT格式的下載文件。我們可以下載所有細胞標誌物的數據集，內容如下。
