原创 fast_qc對測序數據的質控
fast_qc是一款用於測序數據質量分析的java軟件，它的使用非常簡單，這篇文章只簡單記錄fast_qc的使用方法，以及如何讀懂fast_qc的圖形化報告。 fastqc [-o output dir] [--(no)extract]
2021-01-27 01:52:21
原创 序列剪切相關軟件（cutadapt和trimmomatic）
昨天剛剛寫過一篇fastqc對原始下機fastq數據質控的文章（https://www.jianshu.com/p/025a443be536），fastqc可以通過生成多種形式的“統計圖”，通過評估 adapter序列含量、dup率含量、鹼
2021-01-27 01:52:21
原创 fasta和fastq文件格式詳解
1. fasta格式 fasta格式是一種非常簡單的儲存序列的格式（主要是把序列儲存到數據庫中的一種形式），可以儲存核酸序列（RNA/DNA）和氨基酸序列(AA)，主要包括2個部分。 1）以‘>’開始的一行主要儲存“序列的描述信息” 2）序
2021-01-23 18:04:18
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原创 ddPCR--數字微滴PCR
今天是參加簡書的“日更挑戰”第一天，時間匆忙暫且寫一篇簡單的小文章介紹ddPCR吧，我是通過“腫瘤低頻突變檢測”瞭解到這項技術的，後面竟然發現它的應用還挺廣泛。不過這篇文章暫且從“低頻突變檢測”這個角度描述ddPCR的應用，以後有其他應用
2021-01-17 14:45:13
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原创 qPCR與新冠病毒核酸檢測
這篇文章簡單記錄一下qPCR的原理以及它在新型冠狀病毒檢測中的應用，分享給身邊好奇核酸檢測的朋友，參考視頻鏈接：https://www.bilibili.com/video/BV1454y1Q7U2/?spm_id_from=333.78
2021-01-15 22:32:37
原创 10X Genomics單細胞轉錄組測序
10X Genomics的應用基於液滴捕獲技術，相對而言可定製化比較強，通量可以無限制增加，操作方便簡單。 通過液滴包裹單個磁珠和1個細胞，磁珠和細胞發生反應：細胞裂解後釋放mRNA，磁珠上的引物尾巴可以做到與mRNA的特異性結合，從而實
2021-01-15 14:45:26
原创 Illumina測序原理
illumina二代測序平臺特點：基於可逆終止的、熒光標記dNTP，實現邊合成、邊測序的工作 文字描述着實有很多侷限性，文章起草基於這份視頻（雙端index），想要更輕鬆的閱讀體驗建議配合視頻一起看：http://www.bilibili
2021-01-13 14:45:26
原创 《下一站，總統 》-- 希拉里傳
這本書2015年11月出版，按照時間推算，正值希拉里公開參加2016年的總統競選。可謂是蹭了一波時政熱度，只不過後來的結果差強人意，隨着川普的成功逆襲，它就被更多人擱置了角落。豆瓣評分6.1，內容更像是闡述新聞，畢竟它不是希拉里自寫的傳記
2020-12-25 15:08:13
原创 《雨季不再來》&《撒哈拉的故事》
曾經，貓毛認爲“三毛文學”應該是70後和80後的文化盛宴，一直對這種“媽媽輩”的文學不以爲然。偶然接觸了《雨季不再來》，看三毛記錄自己27歲之前的成長自傳，不小心入了坑，那些文字對貓毛而言仍然是有魅力的。 雨季不再來 先讀《雨季不再來》，
2020-12-25 15:08:13
原创 零層級-11.8 活動總結
1. 面對他人的無感請求，你如何拒絕？ 總結：1）拖延回覆 2）賣慘 3）通過反問的方式使對方產生同理心 4）爲對方的請求安置另外一個出口 生活中我們經常會遇到來自各類人的無感請求，有時會礙於面子不好意思拒絕，有時狠心拒絕之後又爲自己傷害
2020-11-13 03:36:37
原创 零層級-10.25活動總結
1. 你會如何保持正能量？ 總結：這是一個非常寬泛的話題，定義正能量：一種積極向上的生活態度。討論小組以“正能量”爲出發點，從“規避負能量”和“維持正能量”兩個方面闡述。 1）規避負能量 避免引發負面情緒的行爲模式 有時候很多不在意的簡單
2020-10-30 15:58:38
原创 零層級-10.18活動總結
1.你覺得改善人際關係應該如何做？ 總結：討論小組根據發展狀態將人際關係分爲3個階段：建立階段、維持階段、離斷階段。然後分別針對不同階段存在的問題討論對應的策略。 1）關係的建立階段 建立良好的社交心態 即怎麼和一個相對陌生的人建立朋友
2020-10-24 16:47:45
原创 series的數據展示方法（畫圖）
series 有很多‘嵌入式功能’，除了之前提到的衆多series的方法，這篇文章主要講series聯合 matplotlib 進行數據的展示。實用性很強呦，不收藏？ 不過，這篇文章的內容確實很少，下面是思維導圖： 對於series，
2020-10-07 17:22:08
原创 零層級-9.20活動總結
1.你如何看待‘不婚’現象？ 觀點：社會的發展給予了我們選擇的權利，我們祝福對的時刻遇到對的人，對待不婚還是接納、認可和尊重。 人類爲何有婚姻 我想，老祖宗們當初創立婚姻制度時，應該沒有考慮到現在的我們有多複雜吧。畢竟，婚姻被認爲是人類文明
2020-09-27 05:05:37
原创 series的方法
本篇文章思維導圖（內容有點多） 學習series的方法之前，瞭解兩個參數, inplace 和 copy它倆在各種方法中反覆無常得出現，都是爲了避免原series被修改而存在的。實質上它倆邏輯是互補的，在一個方法中只會出現一個。 1
2020-09-24 05:09:59